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两种黄盖鲽线粒体DNA部分片段比较分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张岩 1 ; 肖永双 1 ; 高天翔 1 ; 于函 2 ;

作者机构： 1.中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室

2.辽宁师范大学生命科学学院

关键词： 钝吻黄盖鲽;尖吻黄盖鲽;线粒体DNA;核苷酸组成;分歧时间

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2009 年 33 卷 02 期

页码： 201-207

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 比较分析了钝吻黄盖鲽和尖吻黄盖鲽线粒体基因组COI、Cytb基因以及D-loop片段总长度为1 373 bp的核苷酸序列,两种间共检测到107处核苷酸替换,蛋白质编码基因上的核苷酸替代主要是第三密码子位点上的同义替换。核苷酸组成分析结果表明:3个目的片段的鸟嘌呤(G)含量普遍较低,在两个蛋白编码基因第三密码子位点上表现得尤为明显。两种黄盖鲽在线粒体基因组不同片段上存在明显的遗传分化,核苷酸替代速率最快的是D-loop,COI和Cytb核苷酸替代速率基本一致。建议在进行黄盖鲽属鱼类分子系统发育研究时,应该针对不同研究目的选择合适的分子标记。基于Cytb基因片段序列的分析结果表明:钝吻黄盖鲽和尖吻黄盖鲽两种的分岐时间约为200万年,两种间的分化事件发生在更新世(Pleistocene)。

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