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基于元分析的大豆含硫氨基酸相关基因挖掘与信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 邱红梅 1 ; 厉志 2 ; 于妍 3 ; 高淑芹 2 ; 马晓萍 2 ; 郑宇宏 2 ; 孟凡凡 2 ; 侯云龙 2 ; 王跃强 2 ;

作者机构: 1.东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室

2.吉林省农业科学院大豆研究所/大豆国家工程研究中心

3.长春科技学院

关键词: 大豆;含硫氨基酸;元分析;Meta-QTL;候选基因

期刊名称: 中国油料作物学报

ISSN: 1007-9084

年卷期: 2015 年 37 卷 02 期

页码: 141-147

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 提高含硫氨基酸组分是大豆品质改良的重要目标之一。本文借助Consensus Map 4.0高密度大豆遗传图谱,整合了33个含硫氨基酸QTL,并采用元分析方法,确定了8个含硫氨基酸Meta-QTL。通过QTL序列共线性区间分析,在Meta-QTL内筛选到7条用于候选基因发掘的基因组序列。利用基因功能注释,得到16个含硫氨基酸相关基因,包括6个氨基酸合成途径酶基因、1个11S大豆球蛋白A5A4B3亚基基因及9个调控基因。其中调控基因分别编码F-Box、PPR及转录因子3种蛋白。13个基因在NCBI数据库中分别有表达谱及SNP信息。大豆含硫氨基酸候选基因分析,可以为功能标记的开发和分子辅助育种提供有用信息。

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