您好,欢迎访问福建省农业科学院 机构知识库!

鸡肠道大肠杆菌多抗菌株C20耐药性基因的预测和分析

文献类型: 中文期刊

作者: 田容川 1 ; 黄薇 2 ;

作者机构: 1.福建师范大学附属中学

2.福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所

关键词: 鸡肠道细菌;抗生素抗性;耐药性机制;基因组;水平基因转移

期刊名称: 福建农业学报

ISSN: 1008-0384

年卷期: 2017 年 09 期

页码: 932-938

收录情况: 北大核心

摘要: 为揭示动物源大肠杆菌耐药性机制,追踪潜在的抗性基因传播机制及其来源,在先前公布的分离自鸡肠道的多抗耐药性菌株大肠杆菌Escherichia coli C20基因组基础上,对E.coli C20抗生素抗性基因种类、数量、来源及其耐药性机制进行分析。通过与已知的抗生素抗性基因数据库进行对比和注释,一共预测和注释了80个潜在的耐药性基因,包括与先前筛选的7种抗生素抗性对应的抗性基因。其中,喹诺酮类抗生素抗性基因位于C20基因组上,四环素、磺胺类、氯霉素、氨基糖苷类以及大环内酯类抗生素的抗性基因则位于C20环状质粒分子上。基因组聚类分析表明,菌株C20与大肠杆菌K-12菌株DH1、BW2952和MG1655亲缘关系较近,序列相似性97%~99%。3株K-12菌株基因组中没有发现与C20质粒类似的序列,表明C20菌株的抗性基因主要是通过质粒介导的水平基因转移方式从其他环境微生物中获得。

  • 相关文献

[1]番鸭呼肠孤病毒的鉴定. 胡奇林,陈少莺,林锋强,程晓霞,林天龙,江斌,陈仕龙,程由铨,李怡英,朱小丽. 2004

[2]香蕉Ran家族基因的全基因组分析. 张雅玲,方智振,赖钟雄. 2015

[3]3株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析. 杨维星,施少华,陈红梅,万春和,程龙飞,傅光华,林芳,林建生,苏敬良,黄瑜. 2010

[4]鸭圆环病毒基因组序列分析及其C1截短基因的原核表达. 施少华,陈珍,杨维星,傅光华,程龙飞,陈红梅,彭春香,黄瑜. 2009

[5]赤芝全基因组SSR位点的筛选及种质资源遗传多样性分析. 徐晓兰,陈体强,兰进,陈向东,朱风丽,陈虎,石林春,陈士林. 2020

[6]光照诱导广叶绣球菌基因组甲基化分析. 肖冬来,马璐,张迪,王宏雨,林衍铨. 2017

[7]甘薯曲叶病毒福建省分离物的分子鉴定. 李华伟,刘中华,张鸿,林志坚,李国良,林赵淼,许泳清,邱永祥,罗文彬,纪荣昌,汤浩,邱思鑫. 2018

[8]樱桃谷鸭源鹅出血性多瘤病毒(GHPV)全基因组克隆与分析. 万春和,陈翠腾,刘荣昌,程龙飞,施少华,傅光华,陈红梅,傅秋玲,黄瑜. 2018

[9]基因组测序分析广叶绣球菌SP-A菌株的遗传差异. 杨驰,马璐,肖冬来,江晓凌,刘晓瑜,林衍铨. 2021

[10]18个双孢蘑菇核心种质的重测序初步分析. 施肖堃,蔡志欣,郭仲杰,卢园萍,陈美元,廖剑华. 2019

[11]草莓Metacaspase基因家族全基因组鉴定及表达分析. 郑益平,陈坚,朱炳耀. 2020

[12]特色农业微生物基因组研究系统的建立. 郑斯平,陈彬,宋亚娜,关雄,郑伟文. 2010

[13]猪嵴病毒福建株全基因克隆及序列分析. 修金生,胡崇伟,陈如敬,王斌,李涛,陈秋勇,林群群. 2013

[14]鸭圆环病毒PT07基因组序列测定与分析. 施少华,傅光华,程龙飞,陈红梅,万春和,陈珍,彭春香,林芳,黄瑜. 2010

[15]紫芝基因组rDNA序列特征及ITS2二级结构比较. 陈体强,徐晓兰,石林春,应正河,钟礼义. 2023

[16]基于高通量测序的福安刺葡萄基因组初步研究. 陈婷,周平,刘鑫铭,蔡盛华,雷龑. 2017

[17]鹅圆环病毒研究进展. 万春和,黄瑜. 2015

[18]基因Ⅵb亚型半番鸭源新城疫病毒基因组测序及分析. 黄秋芳,孙敏华,陈少莺,吕殿红,董嘉文,尚毅,吴玄光,胡奇林. 2012

[19]生物信息学在药用植物研究中的应用. 郑斯平,陈彬,周莉娟. 2005

[20]种番鸭源禽坦布苏病毒分离鉴定及基因组序列分析. 傅光华,陈红梅,黄瑜,万春和,傅秋玲,程龙飞,施少华,林建生. 2014

作者其他论文 更多>>