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辣椒CONSTANS-like转录因子家族的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李宁 1 ; 高升华 1 ; 王飞 1 ; 尹延旭 1 ; 姚明华 1 ; 焦春海 1 ;

作者机构： 1.湖北省农业科学院经济作物研究所

关键词： 辣椒;CO-like基因家族;生物信息学

期刊名称： 北方园艺

ISSN： 1001-0009

年卷期： 2019 年 15 期

页码： 1-7

收录情况： 北大核心

摘要： CONSTANS(CO)基因介于生物节律钟与下游开花基因之间,是光周期途径中的关键基因。以‘Zunla-1’辣椒基因组数据为试验材料,利用生物信息学工具对辣椒CO-like转录因子基因家族进行研究,以期为进一步揭示CO-like转录因子基因家族在辣椒开花中的作用提供参考。结果表明:‘Zunla-1’辣椒基因组中共有9个CO-like基因,CO-like的蛋白大小相似,理论等电点均小于7;多序列和进化树分析将辣椒CO-like基因家族划分为3个组;利用转录组数据对9个CO-like基因家族成员的基因表达情况进行了分析,发现上述基因在叶片均有表达。

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