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利用小RNA测序技术检测贵州西番莲病毒

文献类型: 中文期刊

作者: 严佳文 1 ; 袁启凤 1 ; 解璞 1 ; 王立娟 1 ; 马玉华 1 ; 王正媛 1 ;

作者机构: 1.贵州省农业科学院果树科学研究所;罗甸县果业产业化发展办公室

关键词: 西番莲;病毒;小RNA测序;鉴定

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2019 年 08 期

页码: 1577-1584

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 病毒病害是西番莲重要病害之一,明确病毒种类可为病害防治提供理论依据。本研究应用小RNA测序技术对6份疑似病毒侵染的西番莲叶片样本进行病毒种类鉴定,发现混合样本中含有黄瓜花叶病毒(Cucumbermosaicvirus,CMV)和夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus, TeMV)。应用RT-PCR分别扩增6份样本中2种病毒的外壳蛋白(coat protein, CP)基因序列,进一步证实6份样本中均含有CMV和TeMV。CMV的CP基因开放阅读框大小为657 bp,与已报道的其他分离物的一致性为82.3%~95.9%;TeMV的CP基因开放阅读框为816 bp,与其他分离物的一致性分别为87.8%~99.3%和87.8%~98.3%。上述结果表明,贵州西番莲中的病毒是CMV和TeMV的分离物,分别命名为CMV-GZ(CP基因登录号为MH623077)、TeMV-GZ1(MH623078)和TeMV-GZ2(MH623079)。

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