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陆地棉超矮秆突变体SSH文库的构建及分析

文献类型： 中文期刊

作者： 马晓杰 1 ; 陈旭升 1 ; 狄佳春 1 ; 刘剑光 1 ; 吴巧娟 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院经济作物研究所/农业部长江下游棉花与油菜重点实验室

关键词： 陆地棉;超矮杆突变体;抑制消减杂交;cDNA文库

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2012 年 28 卷 05 期

页码： 948-956

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以陆地棉超矮秆突变体超矮1号及其近等基因系M104(正常株高)为材料提取棉花总RNA,以M104为促减物(Dirver),超矮1号为被测物(Tester),利用SSH法建立差异表达cDNA文库;分别以超矮1号和M104的cDNA为探针进行反向Northern杂交,筛选差异表达克隆,进行序列相似性分析。结果表明,通过建立差异表达cD-NA文库共获得2 530个克隆,通过反向Northern杂交共筛选到668个差异表达克隆,测序后得到539个质量合格的EST序列,共得到122个Unigene,有36个重叠群,86个单拷贝序列,平均长度1 319.26 bp。这些EST所涉及的基因,主要是与代谢和次生代谢调节、转录调控、生物合成、细胞凋亡、信号传导有关联。SSH文库的构建为陆地棉超矮秆突变形成的相关基因的克隆和结构功能研究奠定了基础。

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