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马唐炭疽菌Colletotrichum hanaui三类Gα亚基基因的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张勇 1 ; 张震 2 ; 邱海萍 2 ; 王艳丽 2 ; 王教瑜 2 ; 孙国昌 2 ;

作者机构： 1.杭州师范大学

2.浙江省农业科学院

关键词： 马唐炭疽菌;G蛋白;Gα亚基;基因克隆;序列分析

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2010 年 22 卷 06 期

页码： 716-721

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用同源克隆的方法,首先克隆马唐炭疽菌Gα亚基基因的同源片段,再通过TAIL-PCR扩增基因片段的上下游邻接序列,经过序列拼接最终成功获得了3类Gα亚基基因cagA,cagB和cagC的全长序列。根据基因序列及CDS序列,运用相关生物学软件对基因序列及其推测蛋白进行了生物信息学分析。基因cagA全长1 380 bp,含5个内含子,编码355个氨基酸;cagB全长1 283 bp,含3个内含子,编码353个氨基酸;cagC全长1 382 bp,含4个内含子,编码354个氨基酸。蛋白同源分析表明,该菌的这3类基因推测蛋白与稻瘟病菌、小麦赤霉病菌中同类基因编码蛋白高度同源,同源率均在75%以上,最高可达99%。

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