文献类型： 中文期刊

作者： 邢广旭 ¹ ; 焦文强 ¹ ; 刘运超 ¹ ; 王治方 ¹ ; 王克领 ¹ ; 徐引弟 ¹ ; 李海利 ¹ ; 张改平 ¹ ;

作者机构： 1.河南省农业科学院

关键词： 猪流行性腹泻病毒;N基因;分子流行病学;序列分析

期刊名称： 山西农业科学

ISSN： 1002-2481

年卷期： 2019 年 010 期

页码： 1830-1833,1837

摘要： 为了解猪流行性腹泻病毒(PEDV)N基因的分子流行病学情况,采用RT-PCR方法对2014-2018年采集到的河南、河北、山东、山西、甘肃、湖北、江西以及上海8省市共205份疑似PEDV阳性病料进行PEDV检测,使用RT-PCR方法扩增得到PEDV的N基因片段,回收PCR产物并与pMD20-T载体进行连接,挑选阳性克隆进行测序,分析研究PEDV遗传变异情况.结果显示,205份样品中,有191份样品为PEDV阳性,共得到19株PEDV的N基因序列,N基因全长均为1 326 bp,没有碱基的缺失和插入;将检测到的PEDV的N基因序列与国内外分离株进行比对发现,核苷酸的同源性为94.8%~99.5%,氨基酸的同源性为95.0%~99.3%.进化树分析发现,得到的19株N基因序列与CV777、CH-S等国内外毒株亲缘关系较远;其中,16株与MN、USA-Indiana-2013、USA-Iowa107-2013等近年分离株在一个分支上,为G2a亚群;CH-HENWZ-2015、CH-HENPY-2014、CH-HENZMDPY-2017这3株序列形成另一个分支,为G2b亚群.综上可知,我国PEDV流行广泛,病毒变异频繁.研究结果可为新型疫苗研发以及检测方法的建立奠定基础.