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山竹子基因组DNA提取及SRAP反应体系优化

文献类型： 中文期刊

作者： 邹明宏 1 ; 郭凌飞 2 ; 曾辉 1 ; 杜丽清 1 ; 陆超忠 1 ; 罗炼芳 1 ; 张汉周 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所

2.广西亚热带作物研究所

关键词： 山竹子;DNA提取;SRAP;体系优化

期刊名称： 经济林研究

ISSN： 1003-8981

年卷期： 2009 年 27 卷 03 期

页码： 41-44

摘要： 采用改良CTAB法提取山竹子基因组DNA,并以me1和em3正反向引物组合对山竹子进行了SRAP体系的优化。结果表明:使用CTAB free缓冲液进行前处理可去除大部分的杂质,获得的DNA纯度较高,OD260/OD280均在1.7~1.9之间,RNA消化彻底,DNA无明显降解,进行SRAP分析条带清晰,多态性好。在25μL反应体系中,5种主要成分的适宜浓度或用量分别是:Taq DNA聚合酶0.5 U,Mg2+2.0 mmol.L-1,dNTPs 0.15~0.2 mmol.L-1,模板DNA 10~50 ng,引物0.6~0.8μmol.L-1。该体系适用于山竹子SRAP分析,进行遗传图谱构建、基因定位与克隆、比较基因组学、遗传多样性、cDNA指纹图谱等方面的研究。

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