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水稻广亲和基因S5-n的功能标记开发及其应用

文献类型： 中文期刊

作者： 杨杰 1 ; 王军 1 ; 曹卿 1 ; 陈志德 1 ; 仲维功 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心

关键词： 广亲和基因S5-n;功能标记;亚洲栽培稻;普通野生稻;杂草稻

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2009 年 35 卷 11 期

页码： 2000-2007

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 广亲和基因S5-n是能够恢复籼、粳杂种育性的基因,利用常规育种方法回交转育广亲和基因需要通过配组杂种F1,根据F1的育性判断和选择S5-n,选育周期长,方法繁琐。因此,在广亲和遗传改良和聚合育种中需要寻找一种快速、简便的广亲和基因检测方法。本研究根据水稻广亲和基因和籼粳S-5等位基因序列存在136bp缺失的特征,设计了InDel标记S5136。前人研究已经明确02428、Dualr、CPSLO17具有S5-n,分子标记S5136 PCR扩增这3个材料的带型为缺失带型,而不携带广亲和基因S5-n的材料的带型为非缺失带型。利用该标记对3037与02428的F2群体分析表明,该标记能准确区分S5-n、S5-i纯合及杂合基因型,标记基因型符合1∶2∶1比例,没有发生偏分离现象。利用该标记从554份水稻品种资源(O.sativa L.)和27份普通野生稻(O.rufipogen Griff.)以及24份江淮流域杂草稻资源中筛选出具有缺失带型的资源材料13份,并对其PCR产物测序证实为S5-n,对Kasalath的广亲和性进行了初步验证;从20份02428的高世代育种材料中,筛选到携带广亲和基因S5-n的恢复系2份。该标记可以用于S5-n基因资源筛选、分子标记辅助选择育种和培矮64S为母本的杂交种种子纯度鉴定。

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