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绒山羊RORα基因2种亚型的结构与进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 吴江鸿 1 ; 刘永志 1 ; 孙海莲 1 ; 张文广 2 ;

作者机构： 1.内蒙古农牧业科学院／中国科学院内蒙古草业研究中心

2.内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室

关键词： 绒山羊;RORα基因;RACE;编码蛋白;进化

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2012 年 17 卷 04 期

页码： 110-117

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为深入研究绒山羊RORα基因的结构及功能,利用cDNA末端快速扩增法(RACE)结合转录组获得了绒山羊(Capra hircus)维甲酸相关孤核受体(retinoic acid receptor-related orphan receptorα,RORα)基因的2个亚型:RORα1和RORα2(GenBank登录号分别是HM_061155和HM_358053)。序列分析表明,RORα1序列全长1 620bp,包括5′端非翻译区(untranslated region,UTR)29bp、3′端非翻译区211bp和开放阅读框(open reading frame,ORF)1 380bp,共编码459个氨基酸,分子质量约为52.3ku,理论等电点6.25。RORα2序列全长1 694bp,包括5′UTR 76bp、3′UTR 211bp和ORF 1 407bp,共编码468个氨基酸;与人RORα4的长度相同,相似性达99%,分子质量约为53.4ku,理论等电点为6.37。结果显示:1)RORα1氨基酸序列缺少大多数核受体具有的调节区(A/B区),预测的二级结构少一个β-折叠基序(YFV);2)RORα的DNA结合区到配体结合区部分属于纯化选择,A/B区在长度和序列方面变异都很大。

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