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芒果CHI基因的克隆及其表达分析研究

文献类型： 中文期刊

作者： 赵志常 1 ; 高爱平 1 ; 陈业渊 1 ; 黄建峰 1 ; 党志国 1 ; 罗睿雄 1 ; 罗石荣 1 ; 麦贤家 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开发实验室

关键词： 芒果;CHI;基因克隆;表达分析

期刊名称： 现代农业科技

ISSN： 1007-5739

年卷期： 2015 年 11 期

页码： 84-86

摘要： 采用RT-PCR和RACE方法从芒果的果实中克隆得到了一个参与花色素苷生物合成的查尔酮异构酶基因(CHI)的全长的c DNA序列,进而对得到的序列采用了TMHMM、DNAman等软件进行生物信息学分析,发现芒果CHI基因包含编码区、3′和5′非翻译区的长度为960 bp的c DNA序列,开放阅读框为753 bp,编码250个氨基酸;等电点为6.46,分子重量为27.03 Kd;对跨膜结构域进行了预测发现,该基因无跨膜结构域;蛋白二级结构元件以无规则卷曲和β-折叠为主;聚类分析发现:该基因与美洲葡萄、葡萄、龙眼和橄榄等植物的亲缘关系较近,而与拟南芥、萝卜、文心兰等亲缘关系较远;分别对红色和绿色的叶片分析发现:该基因主要在红色叶片中表达量比较高。

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