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板栗WRKY基因家族鉴定及其在干旱胁迫下的表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 赵爽 1 ; 葛朝红 1 ; 石鹤飞 2 ; 闵卓 1 ; 王广鹏 3 ; 李伟明 1 ;

作者机构: 1.河北省农林科学院棉花研究所

2.沧州职业技术学院

3.河北省农林科学院昌黎果树研究所

关键词: 板栗;基因家族;WRKY;干旱胁迫

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2024 年 39 卷 001 期

页码: 72-82

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: WRKY转录因子在植物生长和防御反应的调控中发挥着重要作用.为了探究WRKY基因家族在板栗抗旱中的功能,对板栗WRKY基因家族成员进行了鉴定,对其编码蛋白的理化性质、系统发育、结构等进行分析,并通过转录组测序和qRT-PCR技术分析其在干旱胁迫下的表达特征.通过生物信息学技术在板栗中共鉴定到65个WRKY基因家族成员,将其分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3组,其中Ⅱ组根据其结构和系统发育关系分为5个亚组.WRKY基因的结构和保守基序分析表明,外显子数目为1~7个,同一亚组的外显子数目和基序分布类似.WRKY基因保守结构域发生了一定的变异,包括WRKY七肽结构域的缺失,锌指结构的缺失,七肽结构域变异为WRKYGKK、WRKYGRK和WRKYGRK等.转录组测序数据表明,有4个WRKY基因家族成员在样品中没有表达,干旱胁迫诱导表达的WRKY基因家族成员表达量上调的有49个,而表达量下调的WRKY家族成员有11个.以上结果表明,板栗WRKY基因在对干旱胁迫的响应中发挥了重要作用.

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