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越橘SSR反应体系的优化

文献类型: 中文期刊

作者: 崔建民 1 ; 杨忠 2 ; 邹荣仟 1 ; 李亚东 1 ; 温景辉 3 ; 赵爽 4 ;

作者机构: 1.吉林农业大学园艺学院

2.吉林省产品质量监督检验院

3.吉林省农业科学院果树研究所

4.长春工业大学电气与电子工程学院

关键词: 越橘;SSR;反应体系;优化

期刊名称: 吉林农业大学学报

ISSN: 1000-5684

年卷期: 2009 年 31 卷 05 期

页码: 32-37

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以"美登"、"北春"、"蓝丰"为试材,用TIANGEN植物基因组试剂盒提取基因组DNA,对SSR反应体系中的Mg2+浓度、dNTPs浓度、TaqDNA聚合酶用量、引物浓度、DNA模板浓度以及引物CA344F的退火温度进行了优化筛选,探讨了越橘SSR技术中PCR反应体系的主要成分对扩增结果的影响。确定了适合越橘的SSR反应体系:在20μL反应体系中,Mg2+2.0mmol/L,dNTPs0.20mmol/L,TaqDNA聚合酶0.5U,引物浓度0.8μmol/L,DNA模板1.5ng/μL;引物CA344F的最佳退火温度为58℃。利用此反应体系对部分越橘品种进行PCR扩增并用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,扩增结果清晰且DNA谱带多态性丰富,表明该体系稳定可靠,适合越橘的亲缘关系分析。

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