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辣椒不同发育时期果实着色的转录组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 秦于玲 1 ; 申龙斌 1 ; 曹振木 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词： 辣椒果实;RNA-Seq;类胡萝卜素;转录因子

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 017 期

页码： 5576-5583

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究辣椒果实不同发育时期着色的基因表达差异,探究参与或调控辣椒果实类胡萝卜素合成的基因或转录因子.本研究采用RNA-Seq技术对辣椒果实青果期(G)、转色期(B1,果实表面30%左右变色)、转色期(B2,果实表面50%左右变色)和成熟期(R)的辣椒果实进行了转录组测序分析.结果表明,G-vs-B1、B1-vs-B2和B2-vs-R上调和下调的差异表达基因(DEGs)分别为924个和2 188个;DEGs经GO富集分析主要集中在生物调控、应激反应、信号、代谢过程和生长等的生物过程;DEGs经KEGG富集分析主要富集在类胡萝卜素生物合成和淀粉、蔗糖代谢等信号通路,DEGs共注释到3 079个转录因子,包括AP2、MYB、MADS和ERF等类型,转录因子AP2在调控植物类胡萝卜素的生物合成方面已得到证实,但在辣椒果实着色过程中的作用还有待研究.本研究为进一步挖掘辣椒果实着色过程中的关键调控因子,解析调控类胡萝卜素生物合成提供理论基础.

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