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橡胶树死皮病胶乳C-乳清差异表达蛋白质的筛选与鉴定

文献类型: 中文期刊

作者: 闫洁 1 ; 陈守才 1 ; 夏志辉 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院橡胶研究所农业部热带作物栽培生理学重点开放实验室

关键词: 巴西橡胶树;死皮病;双向凝胶电泳;蛋白质组;质谱

期刊名称: 中国生物工程杂志

ISSN: 1671-8135

年卷期: 2008 年 28 卷 06 期

页码: 28-36

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 橡胶树死皮病(tapping panel dryness,TPD)在世界各橡胶种植园普遍发生,给橡胶种植业带来严重的危害。为了更好地了解和阐明死皮病发生、发展的分子机制,应用双向凝胶电泳技术(2-DE)比较橡胶树死皮株与健康株胶乳C-乳清蛋白质组表达的差异。采用固相pH梯度双向凝胶电泳分离橡胶树死皮株与健康株C-乳清的总蛋白质,凝胶经考染显色后,用PDQuest7.40图像分析软件进行比较分析,识别差异表达的蛋白质。这些点经过胶内酶切后进行基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析获取肽质指纹图谱(PMF),Mascot软件搜索SWISS-PROT和NCBInr数据库鉴定蛋白质。结果:(1)橡胶树死皮株与健康株C-乳清凝胶的平均蛋白质点数分别为1075±35和1134±27,其平均匹配的点数分别为982±38和1008±22,组内图像匹配率达91.89%和88.72%。(2)橡胶树死皮株与健康株C-乳清组间的平均匹配蛋白点数为970±25。利用MALDI-TOF-MS质谱技术对40个差异明显的蛋白点进行分析鉴定,通过查询数据库鉴定了27个蛋白质。建立了分辨率高且重复性较好的橡胶树死皮株与健康株胶乳C-乳清的双向凝胶电泳图谱,并应用质谱技术鉴定了其中表达差异的蛋白质点,这些差异表达的蛋白质可能参与了死皮发生和发展的过程。

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