您好,欢迎访问青海省农林科学院 机构知识库!

基于转录组测序的柴达木地区枸杞根腐病发病机理研究

文献类型: 中文期刊

作者: 方泰军 1 ; 侯璐 2 ; 白露超 1 ;

作者机构: 1.青海大学农牧学院

2.青海省农林科学院

关键词: 枸杞;根腐病;转录组;发病机理

期刊名称: 干旱区资源与环境

ISSN: 1003-7578

年卷期: 2022 年 011 期

页码: 133-140

收录情况: 北大核心 ; CSCD ; CSSCI

摘要: 为初步了解柴达木地区枸杞根腐病发病机理,文中通过转录组测序技术对健康和发病枸杞进行测序分析。结果共筛选得到6503个差异表达基因,其中3558个差异上调基因,2945个差异下调基因。通过差异基因GO功能注释分析,GJ(健康组) vs GF(发病组)中差异表达基因主要表现在代谢过程、细胞过程、催化活性、结合、细胞和细胞部分等生物学功能上。KEGG代谢通路分析显示,差异上调基因主要富集在内质网中的蛋白质加工、植物激素信号传导、植物-病原体互作等代谢通路;差异下调基因主要富集在碳代谢、氨基酸生物合成、光合作用生物的碳固定、糖酵解/糖异生、光合作用等通路上。转录因子预测结果显示:24个转录因子表达发生了变化,分别归属于13个转录因子家族,C2H2、TCP、WRKY等多个转录因子的表达均受到不同程度的抑制。利用实时荧光定量PCR技术对挑选的10个关键差异表达基因进行验证,结果显示10个差异表达基因表达趋势与转录组测序相一致。

  • 相关文献

[1]枸杞转录组SSR分布特征分析及其与基因组SSR分布特征的比较. 虞杭,张得芳,樊光辉,王占林. 2018

[2]青海省蚕豆和豌豆病害鉴定. 王晓鸣,王信,朱振东,Joop van Leur,Trevor Bretag,Bassam Bayaa,Safaa Kumari,刘玉皎,贺辰邦,宗绪晓. 2006

[3]油菜不同品种苗期抗根腐病比较. 任钢,杨君丽. 1997

[4]青海省蚕豆品种(系)抗根腐病鉴定. 程亮. 2015

[5]唐古特大黄根腐病病原菌的鉴定. 康胜华,侯璐,朱琳. 2023

[6]青海省豌豆品种(系)抗根腐病鉴定. 程亮. 2014

[7]青海柴达木地区有机枸杞篱架栽培管理技术试验. 吴振山,马明呈,马梦茹. 2016

[8]青海省诺木洪枸杞主要栽培品种的表型研究. 尹孝萍. 2016

[9]“宁杞1号”枸杞辐射诱变育种初报. 樊光辉. 2014

[10]基于RAD测序的枸杞种质研究. 张得芳,夏涛,党少飞,樊光辉,王占林. 2018

[11]青海省诺木洪枸杞主要栽培品种的表型研究. 尹孝萍. 2016

[12]青海枸杞自然变异优选育种试验. 樊光辉,王占林,郑淑霞,郑贞贞,马玉林,卢文晋. 2012

[13]不同土壤水分含量对枸杞光合特性的影响. 段珍珍,王占林,贺康宁,罗龙. 2015

[14]青海柴达木地区枸杞栽培品种品比试验. 樊光辉. 2012

[15]4种植物源杀虫剂对枸杞棉蚜的防效试验. 李秋荣,李玮,闫佳会,祁全梅,李富刚. 2019

[16]柴达木地区枸杞主栽品种果实综合评价. 李晨,张得芳,樊光辉,王占林,谢守忠. 2018

[17]枸杞苯丙氨酸解氨酶基因的克隆与表达分析. 乔枫,耿贵工,张丽,金兰,陈志. 2017

[18]盐分离子对两种枸杞生长的影响. 童翠芸,张得芳,樊光辉,王占林. 2019

[19]篱架栽培模式对枸杞叶片、果实形态特征及产量的影响. 刘晓雯,樊光辉,张得芳,王占林. 2021

[20]主要枸杞品种在柴达木地区的叶形态表现. 吉德娟,张得芳,樊光辉,王占林. 2020

作者其他论文 更多>>