您好,欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库!

基于sRNA的脊尾白虾对低温胁迫的响应研究

文献类型: 中文期刊

作者: 陈吉圣 1 ; 卢雪旎 1 ; 王兴强 1 ; 曹梅 1 ; 李永 2 ; 秦传新 3 ;

作者机构: 1.江苏海洋大学海洋科学与水产学院

2.连云港侨海渔业科技有限公司

3.中国水产科学研究院南海水产研究所

关键词: 低温胁迫;sRNA;miRNA;脊尾白虾

期刊名称: 海洋渔业

ISSN: 1004-2490

年卷期: 2024 年 46 卷 005 期

页码: 616-627

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 由于季节更替或天气骤变,水温骤降时有发生,养殖虾类很容易受到低温胁迫,sRNA分析可为其抗逆分子机制的探索提供新的技术手段。研究了低温胁迫对脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)微小核糖核酸Micro RNA(mi RNA)及其对应靶基因表达的影响,筛选可能与低温调控关联的mi RNA,对体质量(1.27±0.15) g的脊尾白虾进行低温(0℃)处理4 h,对照组水温维持在25℃,sRNA测序得到20.45M bp过滤序列。通过比对获得55个保守的miRNA和9个非保守的miRNA。定量低温胁迫脊尾白虾miRNA表达丰度筛出11个显著上调的miRNA,其中dme-miR-100-3p miRNA上调幅度最大,其次为dme-miR-2491-5p miRNA。599个靶基因差异表达显著,GO分类发现差异表达miRNA对刺激反应、生物调节、粘附、催化活性和代谢过程等靶基因调控显著;COG分类发现差异表达miRNA对蛋白周转和伴侣蛋白、碳水化合物和氨基酸运输和代谢等靶基因调控显著;KEGG富集分析发现靶基因二氢硫辛酯脱氢酶和乳酸脱氢酶在糖酵解/糖异生、丙酮酸代谢、氨基酸代谢和降解等通路得到富集,而靶基因钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶在Wnt信号通路、钙信号通路和ErbB信号通路等得到富集。结果表明,低温环境下差异表达miRNA和相关靶基因在脊尾白虾的跨膜信号转导、蛋白质代谢和碳水化合物代谢等环节的调控中发挥着重要作用,因而推测低温通过脊尾白虾miRNA上调细胞糖酵解和三羧酸循环途径促进体内蛋白质和碳水化合物等底物分解供能来适应逆境。研究结果可为进一步探究脊尾白虾低温胁迫下miRNA差异表达及其功能奠定基础。

  • 相关文献

[1]Conserved and novel heat stress-responsive microRNAs were identified by deep sequencing in Saccharina japonica (Laminariales, Phaeophyta). Liu, Fuli,Wang, Wenjun,Sun, Xiutao,Liang, Zhourui,Wang, Feijiu.

[2]脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)组织蛋白酶D基因的克隆及其表达分析. 段亚飞,刘萍,李吉涛,李健,陈萍,高保全,徐文斐,王有昆. 2013

[3]脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)维甲酸X受体基因克隆及其在温盐胁迫和蜕皮周期中的表达分析. 柳飞,李健,李吉涛,葛倩倩,连春盎,常志强. 2016

[4]脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda) FAMeT基因在卵巢发育周期中的表达分析. 李志敏,李健,李吉涛,何玉英,葛倩倩,索帅. 2016

[5]脊尾白虾14-3-3基因cDNA全长的克隆和表达分析. 王有昆,刘萍,李吉涛,李健. 2016

[6]脊尾白虾抗细胞凋亡因子DAD1基因的克隆及其组织表达分析. 段亚飞,刘萍,李吉涛,李健,高保全,陈萍. 2014

[7]碳酸盐碱度对脊尾白虾生存、生长、繁殖及免疫酶活性的影响. 柳飞,李健,李吉涛,葛倩倩,葛红星,沈明明. 2016

[8]脊尾白虾对低盐胁迫响应的转录组学分析. 沈晔,王兴强,曹梅,郑年昊,陈百尧,秦传新. 2020

[9]脊尾白虾对低氧响应的转录组学分析. 曹梅,王兴强,秦传新,沈晔,张子杨,钱诗悦. 2021

[10]盐度对脊尾白虾生长和肌肉营养成分的影响. 姜巨峰,吴会民,郭华阳,张振国,刘肖莲,夏苏东,庄保陆,付志茹. 2014

[11]南极磷虾(Euphausia superba)与脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)营养学特征分析及鲜味评价. 曹荣,赵玲,孙慧慧,刘淇. 2018

[12]脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)3个野生群体mtDNA 16S rRNA序列差异及长臂虾科系统进化关系. 马朋,刘萍,李健,李吉涛,高保全. 2012

[13]脊尾白虾丝氨酸蛋白酶抑制剂基因克隆及表达分析. 李洋,刘萍,李健,李吉涛,马朋,高保全. 2013

[14]脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)不同地理群体的生化遗传分析. 李吉涛,段亚飞,李健,陈萍,刘萍,高保全. 2013

[15]池养脊尾白虾的生长与繁殖特性. 于天基,李健,李吉涛,任海,梁忠秀,葛红星. 2014

[16]盐度对脊尾白虾亲虾抱卵及其子代生长发育的影响. 梁俊平,李健,李吉涛,刘萍,赵法箴,聂国兴,李学军,孔祥会. 2014

[17]维拉帕米对脊尾白虾体内恩诺沙星代谢及消除的影响. 梁俊平,王芸,李健,李吉涛,聂国兴,孔祥会,李学军. 2015

[18]脊尾白虾3个野生群体ITS1序列分析及其亲缘关系分析. 马朋,刘萍,李健. 2012

[19]脊尾白虾肌球蛋白重链和肌球蛋白轻链基因的克隆与表达分析. 王佳佳,李健,葛倩倩,高海钰,李吉涛,赵法箴. 2019

[20]脊尾白虾形态性状对体重的相关性及通径分析. 李洋,刘萍,李健,高保全. 2012

作者其他论文 更多>>