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应用基因芯片分析红蚰麦白粉菌胁迫条件下的基因表达谱

文献类型： 中文期刊

作者： 王俊美 1 ; 刘红彦 1 ; 徐红明 1 ; 王飞 1 ; 高素霞 1 ; 康振生 2 ;

作者机构： 1.河南省农业科学院植物保护研究所

2.西北农林科技大学植保资源与病虫害治理教育部重点开放实验室

关键词： 小麦;抗白粉病基因;基因芯片;表达序列标签;实时定量PCR

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2009 年 35 卷 07 期

页码： 1188-1193

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 小麦农家品种红蚰麦携带1对显性抗白粉病新基因,暂命名为Pmhym。为了深入了解该品种抗病的分子机制,用豫麦13/红蚰麦的F3代纯合抗病株系构建抗池,采用Affymetrix小麦基因芯片技术,以白粉菌接种0h为对照,分析白粉菌接种后24h的基因表达谱。在61127基因微矩阵点中,有效差异表达Ratio值≥2或≤0.5的基因共5282个,其中上调基因2553个,下调2729个。对上调序列的分类表明,功能明确的序列中39.81%与抗病/防御相关;下调表达基因中以能量代谢和抗病/防御相关基因比例最高,分别占26.71%和19.65%。上调表达在8倍以上的序列中81个的功能已知,其中包括病程相关基因、防卫反应基因、生成或清除活性氧的基因,以及抗病信号转导基因等。选取上调和下调表达8倍以上的共13个探针序列进行实时定量PCR验证,表明基因芯片数据具有良好的重复性。

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