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菜用大豆蔗糖转运蛋白生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张玉梅 1 ; 胡润芳 1 ; 林国强 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院作物研究所

关键词: 菜用大豆;蔗糖转运蛋白;生物信息学分析;GmSUT基因

期刊名称: 大豆科学

ISSN: 1000-9841

年卷期: 2018 年 37 卷 006 期

页码: 866-870

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为揭示菜用大豆SUT基因的结构特点,并为提高其表达活性提供理论依据,利用RT-PCR技术克隆菜用大豆SUT基因,长度为1 634 bp,编码区1 566 bp,编码一个含有521个氨基酸残基的多肽.生物信息学分析表明,SUT理论等电点9.33,理论分子量55.19 kD,是疏水性蛋白.SOMPA分析表明,SUT各个氨基酸残基对应的二级结构为α螺旋45.11%、β折叠14.20%、无规则卷曲36.47%和β转角4.22%;氨基酸序列和结构分析显示SUT蛋白包含1个保守区,即MFS2 domain和12个跨膜区.SignalP分析表明该蛋白没有信号肽.系统进化树分析表明菜用大豆GmSUT蛋白与绿豆(Vignaradiata var.radiata)的亲缘关系最近,同源性达93.28%.将该蛋白与拟南芥的9个SUC蛋白比对表明GmSUT与AtSUC2的亲缘关系最近,属于SUT1亚族.

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