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用于检测仔猪致病菌的23S rRNA基因芯片的研制

文献类型： 中文期刊

作者： 伍诚意 1 ; 曹峰子 2 ; 梁之昶 3 ; 章振华 1 ; 杨兵 1 ;

作者机构： 1.北京市农林科学院畜牧兽医研究所

2.河北农业大学

3.新疆农业大学动物医学院

关键词： 仔猪;致病菌;23S rRNA基因;芯片;寡核苷酸探针

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2010 年 03 期

页码： 258-264

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以副猪嗜血杆菌、胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌、大肠杆菌、肠道沙门氏菌、猪链球菌等12种仔猪致病菌为目标细菌,23SrRNA基因为靶基因,从GenBank中下载其23SrDNA全序列,在其变异区设计特异性探针,在保守区设计通用引物。通过序列分析、PCR靶标与探针杂交试验,建立了有13条寡核苷酸探针和2对通用引物的仔猪常见致病菌基因芯片检测方法。以参考菌株粗提基因组DNA的10倍系列稀释模板做PCR,扩增产物与探针杂交,检出芯片的灵敏度为100fg。对33个参考菌株用芯片检测,结果有1例不正确,只鉴定到属;在61个野外分离株中,55株的芯片检测结果与生化或测序结果一致,有6例不一致,符合率为90%。初步研究证明,该检测方法能快速、有效地鉴定多种仔猪常见致病菌,但要区分某些细菌的致病株与非致病株,还要检测毒力/毒素基因。

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