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基于RAD测序的枸杞种质研究

文献类型： 中文期刊

作者： 张得芳 1 ; 夏涛 1 ; 党少飞 1 ; 樊光辉 1 ; 王占林 1 ;

作者机构： 1.青海省农林科学院;省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室;青海康普生物科技股份有限公司;细胞生物学实验室中国林科院林业研究所

关键词： 枸杞;RAD-seq;遗传背景

期刊名称： 青海科技

ISSN： 1005-9393

年卷期： 2018 年 05 期

页码： 15-21

摘要： 枸杞是一种具有悠久栽培历史的重要药食两用植物。但是由于各种原因,野生枸杞品种与地方品种之间的遗传关系一直不清楚,这在很大程度上阻碍了现代枸杞育种工作。本研究中,我们收集了19份枸杞种质,并利用RAD标记研究这些种质之间的遗传关系。测序后共得到了30.32Gb的clean data,平均每个样本为1.596Gb。平均比对率为85.7%,平均覆盖深度为6.76x,系统发育结果将所有种质清晰的区分。所有栽培品种都与宁夏枸杞有共同的祖先,这表明宁夏枸杞可能参与了这些地方品种的培育。一些地方品种即"宁杞"系列,"青杞-1"和"蒙杞-1",得到了系统发育结果的支持,而三倍体枸杞被证明是建立在"宁杞-1"和四倍体枸杞杂交的基础上的。本研究揭示了枸杞的遗传背景,为枸杞的物种分类、加入鉴定和保护以及枸杞杂交品种的生产奠定了基础。

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