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miRNA-mRNA联合分析研究抑制miR-99b-3p对山羊骨骼肌卫星细胞的影响机制

文献类型: 中文期刊

作者: 林月霞 1 ; 吕玉华 1 ; 朱丽慧 1 ; 戴建军 1 ; 张德福 1 ; 廖荣荣 1 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院畜牧兽医研究所

关键词: miR-99b-3p;骨骼肌;联合分析;山羊;转录组

期刊名称: 上海农业学报

ISSN: 1000-3924

年卷期: 2024 年 40 卷 005 期

页码: 55-63

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为深入探讨抑制miR-99b-3p对山羊骨骼肌细胞发育的影响机制,建立了地塞米松诱导的山羊骨骼肌卫星细胞(Skeletal muscle satellite cells,SMSCs)应激模型并转染miR-99b-3p,并通过转录组测序研究抑制miR-99b-3p对SMSCs的分子调控机制。结果表明:转染miR-99b-3p可促进SMSCs细胞增殖以及肌肉分化基因MyoG和MyoD的表达,抑制miR-99b-3p则会抑制细胞增殖和分化基因表达,并导致细胞中761个基因差异表达。KEGG分析显示,差异基因大多富集于与疾病相关的通路;GO富集分析表明,差异基因主要参与细胞增殖和DNA修复相关生物学过程。此外,鉴定到17个差异表达的miRNAs,包含9个上调和8个下调miRNAs。对差异miRNA靶基因进行预测分析,并与差异基因比对,筛选到18个重叠的差异基因,这些差异基因主要富集于与致病相关的通路。本研究可为阐明断奶应激对山羊生长发育的分子调控机制提供理论依据。

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