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梨Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张靖国 1 ; 胡红菊 1 ; 田瑞 1 ; 陈启亮 1 ; 杨晓平 1 ;

作者机构： 1.湖北省农业科学院果树茶叶研究所

关键词： Ty1-copia类逆转座子逆转录酶;梨(Pyrus);克隆;序列分析

期刊名称： 湖北农业科学

ISSN： 0439-8114

年卷期： 2012 年 51 卷 19 期

页码： 4388-4390

收录情况： 北大核心

摘要： 根据Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的保守区设计简并引物,从10份梨属(Pyrus)材料中扩增该逆转座子片段。扩增产物经纯化后克隆于pMD18-T质粒载体,选择阳性克隆,再经菌落PCR鉴定、测序及序列分析,获得了14条梨Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列。这些核苷酸序列长度为250～267 bp,具有较高的异质性,主要表现为缺失突变,通过核苷酸聚类可将14条序列分为4个家族。对这些片段的氨基酸序列进行分析,结果显示有2个序列发生了终止密码子突变。该研究获得的梨属植物Ty1-copia类逆转座子逆转录酶氨基酸序列与已报道的其他生物的相应序列有较高的一致性。

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