文献类型： 中文期刊

作者： 姜帆 ¹ ; 丁新华 ² ; 梁亮 ³ ; 付开赟 ² ; 郭文超 ² ; 朱水芳 ⁴ ;

作者机构： 1.三亚中国检科院生物安全中心

2.新疆农业科学院植物保护研究所

3.农业农村部规划设计研究院

4.中国检验检疫科学研究院

关键词： 纳米孔测序;实蝇;昆虫;鉴定;扩增子

期刊名称： 生物安全学报(中英文)

ISSN： 2095-1787

年卷期： 2024 年 33 卷 001 期

页码： 93-98

收录情况： CSCD

摘要： [目的]纳米孔测序技术是单分子实时测序技术的一种,正在被广泛应用于临床快速诊断及微生物检测等领域.本研究以实蝇这一类重要的检疫性有害生物为例,探究该技术在昆虫检疫鉴定中应用的可行性,为昆虫检疫鉴定提供新方法.[方法]分别采用一代测序技术和纳米孔测序技术,对14种经形态学鉴定的实蝇成虫进行DNA条形码测序,通过BOLD和NCBI数据库对测序结果进行比对分析,并比较2种测序技术所得序列结果准确性的差异.[结果]通过纳米孔测序,14个实蝇样品在44 min内获得181 Mb bases,每个样品平均得到11280条reads,单个reads的准确度为92.10%~94.53%;经一致性序列校正,所有实蝇样品均可得到与一代测序结果完全一致的序列,序列分析结果与形态学鉴定结果完全一致.[结论]采用本研究的实验流程和数据分析方法,纳米孔测序技术可以应用于实蝇类害虫的检疫鉴定,测序结果准确、高效;本研究提供的实验方案同样适用于基于扩增子测序的物种鉴定,满足大规模样品的高通量精准鉴定需求.