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水稻核糖体失活蛋白家族基因OsRIP8的生物信息学与功能分析

文献类型： 中文期刊

作者： 徐娅 1 ; 黄佑岗 1 ; 李树杏 1 ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院水稻研究所

关键词： 水稻;核糖体失活蛋白;生物信息学分析;功能分析;基因表达

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2024 年 52 卷 004 期

页码： 71-79

收录情况： 北大核心

摘要： 核糖体失活蛋白(RIPs)是一种能使真核细胞核糖体功能被抑制的毒蛋白.OsRIP8是属于该家族的一个功能未知基因.为研究该基因生物学功能,通过数据库对其进行生物信息学分析,利用qRT-PCR验证其表达模式,同时构建OsRIP8-RNAi干涉载体并利用农杆菌转化水稻,采用PCR技术鉴定出转基因阳性植株,分析阳性植株的表达和农艺性状,初步揭示该基因的功能.结果表明,水稻OsRIP8蛋白为不稳定亲水蛋白,不含信号肽及完整的跨膜结构域,蛋白结构以α螺旋为主;在OsRIP8基因启动子区域存在着与植物生长发育、生物与非生物胁迫以及植物激素响应有关的元件;OsRIP8基因的共表达基因富集到多种大分子的生物合成与蛋白代谢等途径;qRT-PCR分析结果表明,OsRIP8基因在发育的小穗及抽穗前1 d的花药中优先表达;RNAi干涉后OsRIP8基因的表达下调造成植株花粉育性和结实率显著降低.暗示该基因对水稻小穗的发育具有重要作用,可能参与调控花粉发育过程.

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