文献类型： 中文期刊

作者： 阮城城 ¹ ; 胡福初 ¹ ; 王祥和 ¹ ; 吴凤芝 ¹ ; 周文静 ¹ ; 吴文碟 ¹ ; 周瑞云 ¹ ; 陈哲 ¹ ;

作者机构： 1.海南省农业科学院热带果树研究所海南省热带果树生物学重点实验室农业部海口热带果树科学观测实验站

关键词： 荔枝;GRF;基因家族;生物信息学;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2021 年 020 期

页码： 6671-6681

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： GRF转录因子参与多种生长发育过程,包括根、茎、叶和花的发育等。本研究基于荔枝转录组测序结果,共鉴定出22个GRF基因并分析其蛋白理化性质、系统进化、基因结构、miRNA靶基因和组织表达分析。结果表明,22个GRF蛋白的大小为72～246 aa,分子量为8 055.41～250 929.9 Da,等电点为4.96～10.44。大部分GRF蛋白为亲脂蛋白并主要定位于细胞核中。系统进化分析将其分为6类,相较于水稻,荔枝与拟南芥GRF的亲缘关系更近。22个GRF基因均含有WRC或QLQ结构域,同一类基因含有相似的基序。miRNA靶基因预测发现荔枝中有14个GRF是miRNA的靶基因,并且均通过mRNA裂解的方式抑制其表达。表达相关性分析表明,10个GRF基因与GA相关基因的表达存在显著或极显著的正相关。大部分GRF基因的表达水平在‘妃子笑’中高于‘紫娘喜’,且大部分基因在顶芽的表达水平显著高于叶。而两个品种中,LcGRF1、LcGRF20和LcGRF22的表达水平均呈现叶高于顶芽的表达模式,表明其可能参与叶的发育调控。本研究为进一步研究荔枝GRF基因的功能提供了科学依据。