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白羊草叶片和根系干旱胁迫下microRNAs差异表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李春艳 1 ; 董洁 1 ; 钟华 1 ; 董宽虎 1 ;

作者机构： 1.山西农业大学动物科技学院;山西省农业科学院畜牧兽医研究所;北京市科学技术情报研究所

关键词： 白羊草;干旱胁迫;MiRNA;生物信息学

期刊名称： 草地学报

ISSN： 1007-0435

年卷期： 2019 年 03 期

页码： 539-546

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探索干旱胁迫下白羊草miRNAs的组织特异性,本研究在干旱胁迫下白羊草(Bothriochloa ischaemum)转录组数据的基础上,采用Illumina测序技术和生物信息学方法,对干旱胁迫和正常生长条件下白羊草苗期叶片和根系miRNAs(microRNAs)进行鉴定和表达分析研究。结果从4个库中鉴定出白羊草中有属于20个家族的79个已知miRNAs和92个新miRNAs。干旱胁迫后叶片和根系中差异表达的miRNAs分别有65个(上调28和下调37)和27个(上调15和下调12)。响应干旱胁迫的主要miRNAs为miR156,miR164,miR166,miR169,miR172,miR396,miR398,miR408,miR528。对这些miRNAs预测的靶基因进行GO生物功能和KEGG代谢通路富集分析表明,植物激素信号转导是叶片和根系响应干旱胁迫共同富集的主要代谢通路,而黄酮类化合物生物合成则是干旱胁迫下叶片富集的最主要代谢通路。

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