文献类型： 中文期刊

作者： 吴丹 ¹ ; 陈四清 ² ; 柯翎 ³ ; 张子阳 ² ; 朱金超 ² ; 潘鲁莹 ² ; 李凤辉 ² ; 徐荣静 ⁴ ; 彭立成 ⁵ ; 边力 ² ;

作者机构： 1.上海海洋大学水产与生命学院

2.海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所

3.福建省农业科学院生物技术研究所

4.烟台开发区天源水产有限公司

5.宁德市南海水产科技有限公司

关键词： 绿鳍马面鲀;转录组;性腺;差异表达基因

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 2095-9869

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 53-64

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探明绿鳍马面鲀(Thamnaconusseptentrionalis)性腺发育相关基因表达特征，优化亲本生殖调控技术，本研究对绿鳍马面鲀雌雄亲体的精巢和卵巢进行了转录组测序分析，经de novo拼装，最终获得119 219个单基因(unigene),N50长度为1 255 bp。在NR、NT、KO、Swiss Prot、PFAM、GO及KOG数据库分别注释到24 009、35 057、18 453、26 971、30 294、11 420和21 613个unigene。绿鳍马面鲀精巢和卵巢转录组中存在18 954个差异表达基因(DEG)，相对于精巢，在卵巢中上调表达的基因有11 265个，下调表达的有7 689个。选取bmp2、sox3、figla、hsd17b1、cyp19a、cyp17、foxl2、star和amh 9个DEGs进行实时荧光定量PCR (qRT-PCR)验证，结果显示，qRT-PCR结果与RNA-Seq分析相一致。GO和KEGG富集结果分析发现，amh、cyp17和star可能在绿鳍马面鲀雄性精子发生过程中起关键作用；bmp2、foxl2、cyp19a、figla和hsd17b1在雌性卵子发生和卵巢类固醇生成过程中发挥重要作用。本研究通过比较绿鳍马面鲀精巢和卵巢的转录组表达差异，初步阐明了精巢和卵巢的基因表达特征，为进一步研究绿鳍马面鲀的性腺发育机制奠定了基础。