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黄灯笼辣椒辣椒素合成相关基因CCaPun1(酰基转移酶)生物信息学和表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 申龙斌 1 ; 刘子记 1 ; 曹振木 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室

关键词： 黄灯笼辣椒;酰基转移酶;基因克隆

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2016 年 02 期

页码： 322-327

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究根据已发表的辣椒基因组序列信息,设计PCR引物,利用RT-PCR的方法从海南黄灯笼辣椒中克隆了辣椒素合成相关基因Pun1基因(酰基转移酶基因),并命名为CCa Pun1基因。通过生物信息学及表达分析发现,该基因CDS区全长1 323 bp,编码440个氨基酸,推测为亲水蛋白;蛋白二级结构中α-螺旋占42.05%,延伸链占14.55%,无规则卷曲占33.64%,β-转角占9.77%。与灌木状辣椒及一年生辣椒的亲缘关系最近,分别达99.4%、98.3%。表达量分析发现,CCa Pun1基因在果实绿熟期表达量最高,其次为幼果期和膨大期。CCa Pun1基因的克隆与表达分析可为海南黄灯笼辣椒辣椒素合成相关机制的进一步研究奠定理论基础。

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