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“中国春”小麦全基因组中特异SSR标记的发掘及其分布特征

文献类型: 中文期刊

作者: 崔婷 1 ; 王长彪 2 ; 韩斌 2 ; 赵兴华 2 ; 刘江 2 ; 任永康 2 ; 牛瑜琦 2 ; 唐朝晖 3 ;

作者机构: 1.山西大学生物工程学院;山西省农业科学院生物技术研究中心;山西省农业科学院作物科学研究所

2.;山西大学生物工程学院;山西省农业科学院生物技术研究中心;山西省农业科学院作物科学研究所

3.;山西大学生物工程学院;山西省农业科学院生物技术研究中心;山西省农业科学院作物科学研究所;

关键词: SSR;小麦;特异标记;单位点标记;全基因组

期刊名称: 山西农业科学

ISSN: 1002-2481

年卷期: 2017 年 06 期

页码: 877-880

摘要: SSR标记尤其是不同染色体上的单位点特异性SSR标记能为进行小麦基因组分子进化研究、遗传多样性分析、指纹图谱和遗传图谱构建、品种真实性鉴定等方面提供更加方便的工具。利用生物信息学技术从山西省农科院生物技术研究中心开发的295 267对"中国春"全基因组SSR分子标记中发掘得到了单位点标记102 287对,其中,不同染色体上特异标记80 374对;A,B,D这3个基因组上特异标记分别是26 738,31 707,21 929对,3个基因组共有的标记有3 293对;80 374对特异分子标记定位到"中国春"小麦全基因组上时,3B染色体定位的特异标记最多,达到5 756对,其次是2B染色体上,为5 680对,最少的是4D染色体上,为2 598对。对不同染色体开发的单位点SSR标记定位全基因组分析表明,定位到不同染色体上最多的标记来源主要集中在2B和5A染色体上。

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