文献类型： 中文期刊

作者： 刘文豪 ¹ ; 田琴 ¹ ; 王旭文 ¹ ; 余渝 ¹ ; 司爱君 ¹ ; 赵福相 ¹ ; 孔宪辉 ¹ ;

作者机构： 1.新疆农垦科学院棉花研究所农业部西北内陆区棉花生物学与遗传育种重点实验室

关键词： 陆地棉;长链酰基辅酶A合成酶;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2021 年 013 期

页码： 4224-4231

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 长链酰基辅酶A合成酶（LACS）是脂肪代谢网络中的关键酶,催化长链酰基辅酶A的合成并在多种生物过程中发挥作用。本研究以拟南芥中长链酰基辅酶A合成酶家族的基因序列为参考来探究LACS在陆地棉基因组中的数量和分布情况。通过生物信息学方法综合分析陆地棉GhLACS基因家族,发现该家族含有21个成员,CDS序列长度为1 938～2 274 bp,编码氨基酸数量为645～757个,定位在15条染色体上。SOPMA预测蛋白二级结构,发现该家族成员的蛋白二级结构均以α-螺旋、β-转角、延伸链、无规则卷曲组成。亚细胞定位分析发现7个基因定位在过氧化物酶体,6个基因定位在叶绿体,8个基因定位在内质网。基因结构分析表明同一亚组内含子和外显子的排列分布较为相似,而不同亚组间存在一定的差异性。本研究有助于了解陆地棉Gh LACS家族的功能,并且为棉籽油脂质代谢提供理论依据。