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海南竹柏扁枝植原体基于16S rRNA和tuf基因的分类及系统进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨毅 1 ; 赵文军 2 ; 车海彦 2 ; 曹学仁 2 ; 罗大全 2 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所

2.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所;中国检验检疫科学研究院植物检疫研究所

关键词： 竹柏;扁枝病;植原体;分类;tuf基因

期刊名称： 农业科技与信息

ISSN： 1003-6997

年卷期： 2016 年 35 期

页码： 82-84

摘要： 对采自海南省万宁市的表现竹柏扁枝病的竹柏植株总DNA进行植原体16S r RNA基因和tuf基因克隆、测序,分别获得竹柏扁枝植原体16S r RNA基因(1 806 bp,Gen Bank登录号:KJ848639)和tuf基因(845 bp,Gen Bank登录号:KX645669)片段。对竹柏扁枝植原体16S r RNA基因序列进行虚拟RFLP分析,结果表明,竹柏扁枝植原体属于花生丛枝植原体组U亚组(16Sr II-U)成员(相似系数为1.00)。对tuf基因进行序列比对和系统进化分析,结果表明,竹柏扁枝植原体与同属16Sr II组的植原体亲缘关系最近,其次为16Sr I组植原体。本研究从亚组水平上确定了竹柏扁枝植原体的分类地位,并克隆分析了竹柏扁枝植原体的tuf基因,为竹柏扁枝植原体的系统分类和病害防控提供了基础信息。

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