文献类型： 中文期刊

作者： 曾涛 ¹ ; 吉训聪 ¹ ; 芮凯 ¹ ; 符美英 ¹ ; 田威 ¹ ; 马瑞 ¹ ; 黄伟康 ¹ ;

作者机构： 1.海南省农业科学院植物保护研究所

关键词： 抗槟榔黄化病毒药物;RNA聚合酶;虚拟筛选;分子动力学模拟;MM/GBSA计算;药物设计

期刊名称： 农药

ISSN： 1006-0413

年卷期： 2022 年 61 卷 001 期

页码： 24-28,33

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]基于槟榔黄化病毒的RNA依赖性RNA聚合酶筛选抗槟榔黄化病毒先导化合物.[方法]使用基于片段的药物设计方法,从PADFrag农药分子片段子库中筛选出14个片段作为骨架进行生长,得到140个分子,取11个CDOCKER得分靠前的分子进行分子动力学模拟和MM/GBSA计算以评估这些分子与RNA依赖性RNA聚合酶的亲和力,最后确定2个优选分子作为潜在的抗槟榔黄化病毒先导化合物.[结果]2个优选分子能以范德华力、静电相互作用以及氢键等方式与靶点稳固结合,有潜在的抗槟榔黄化病毒活性.[结论]2个优选分子可作为先导化合物用于新型抗槟榔黄化病毒药物开发.