文献类型： 中文期刊
作者： 苏慧慧 1 ; 李涛 2 ; 黎振兴 2 ; 李植良 2 ; 王永飞 1 ;
作者机构： 1.暨南大学生命科学技术学院
2.广东省农业科学院蔬菜研究所
关键词： 番茄;GRX基因家族;生物信息学;表达分析
期刊名称： 核农学报
ISSN： 1000-8551
年卷期： 2015 年 29 卷 04 期
页码： 663-673
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： GRX基因家族是从原核生物到真核生物中普遍存在的一类巯基-二硫键氧化还原酶,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中均发挥重要作用。本研究在番茄基因组范围内,利用生物信息学方法对番茄的GRX基因组家族的成员、分布及结构和功能等进行分析。预测结果显示,番茄GRX家族包含55个蛋白质,分为4个亚族,其中植物特有的CC亚族成员最多,有35个,其他GRX基因成员与拟南芥GRX家族具有相似分类。在番茄GRX结构域中包含12个重要的基序,主要分布在序列的N端,相同亚族中的GRX成员蛋白序列的氨基酸保守域构成基本一致,且各亚族成员的氨基酸保守域组成特异,表明这些基序的存在对GRX蛋白功能的执行是必需的。利用实时荧光定量PCR对番茄GRX基因的组织表达和胁迫响应分析,结果表明,GRX基因具有组织特异性表达差异,CC型在根和花中表达较高,在果实中表达较低;在盐、SA、ABA、高温和低温胁迫条件下,22个番茄GRX基因的表达模式被阐明;其中部分基因的表达水平被显著地诱导增加或者降低,很可能参与了调控番茄逆境胁迫条件下的防御应答反应。本研究结果将为番茄GRX家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析GRX基因功能奠定基础。
- 相关文献
[1]花生赤霉素3-β-双加氧酶(AhGA3ox)基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 李海芬,鲁清,刘浩,温世杰,王润风,黄璐,陈小平,洪彦彬,梁炫强. 2024
[2]荔枝VQ基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应. 凡超,杨杰,陈蓉,刘伟,向旭. 2024
[3]中国辣椒AAT基因家族的鉴定及表达分析. 衡周,叶楚,方健敏,杨静,徐小万,徐晓美,李涛,王恒明. 2023
[4]白木香AsOMT1基因的克隆与表达分析. 杨艳,朱家红,曾军,梅文莉,戴好富,彭世清. 2023
[5]海南龙血树金属硫蛋白基因DcMT2的克隆和表达分析. 丁旭坡,吴春来,彭世清,梅文莉,戴好富. 2018
[6]荔枝HSP70家族鉴定及其响应非生物胁迫的表达分析. 凡超,杨杰,陈蓉,刘伟,向旭. 2024
[7]冬瓜WRKY基因家族鉴定及表达分析. 赵添悦,蔡金森,王敏,谢大森,杨松光,崔晓娟,高苏娟. 2024
[8]墨兰CsAP1-A基因克隆及表达分析. 周荣,刘嘉超,杨凤玺. 2023
[9]番茄组蛋白乙酰转移酶(HAT)的全基因组鉴定与分析. 史建磊,熊自立,李涛,张海利,宰文珊. 2020
[10]番茄AT-hook基因家族的鉴定及胁迫条件下的表达分析. 丁丽雪,李涛,李植良,徐小万,李颖,王恒明,王永飞,马三梅,黎振兴. 2016
[11]番茄HDACs家族基因在胁迫条件下的表达分析. 李涛,苏慧慧,李植良,徐小万,王恒明,李颖,黎振兴. 2015
[12]Ⅰ型鸭疫里默氏杆菌铁依赖抑制子RaDtxR基因的发现及生物信息学分析. 袁建丰,覃宗华,吕敏娜,吴彩艳,余劲术,孙铭飞,蔡建平. 2010
[13]马铃薯多酚氧化酶基因家族生物信息学及表达分析. 王丽,王万兴,索海翠,胡新喜,秦玉芝,李小波,熊兴耀. 2019
[14]‘航花2号’的Δ~(12)脂肪酸脱氢酶(FAD2)基因的生物信息学分析. 温世杰,李杏瑜,洪彦彬,李少雄,周桂元,陈小平,梁炫强. 2017
[15]‘航花2号’的Δ~(12)脂肪酸脱氢酶(FAD2)基因的生物信息学分析. 温世杰,李杏瑜,洪彦彬,李少雄,周桂元,陈小平,梁炫强. 2017
[16]转香蕉MaASR1基因的拟南芥株系在干旱胁迫条件下的表达谱分析. 张丽丽,徐碧玉,刘菊华,贾彩红,张建斌,金志强. 2017
[17]中泰南五味子转录组测序及生物信息学分析. 李静宇,徐友阳,蔡时可,王继华. 2022
[18]花生AT-hook家族基因的生物信息学分析. 胡冬秀,刘浩,梁炫强,吴自明,方加海. 2021
[19]巴西蕉WRKY转录因子的鉴定及其枯萎病胁迫下的表达. 贾彩红,王卓,王静毅,张建斌,金志强,徐碧玉. 2019
[20]龙眼果肉自溶相关基因DlMC4的克隆和表达分析. 谷李桃,帅良,罗焘,况梦玲,韩冬梅. 2017
作者其他论文 更多>>
-
茄子种质资源表型遗传多样性分析及综合评价
作者：江姚兰;陈冠龙;李涛;孙保娟;李植良;游倩
关键词：茄子;种质资源;表型评价
-
专题：辣椒遗传育种与栽培生理
作者：李涛
关键词：
-
上位基因控制的茄子果色遗传效应解析
作者：陈锦溶;吕紫见;范丽莎;游倩;李涛;宫超;孙光闻;李植良;孙保娟
关键词：茄子;果色;上位基因;花青素;遗传规律
-
中国辣椒AAT基因家族的鉴定及表达分析
作者：衡周;叶楚;方健敏;杨静;徐小万;徐晓美;李涛;王恒明
关键词：中国辣椒;醇酰基转移酶;生物信息学;实时荧光定量PCR;基因鉴定;表达分析
-
安徽地区樱桃番茄早春大棚栽培技术
作者：周磊;刘娜;郭子卿;蒋怡朗;沈曙光;韦小飞;李涛
关键词：安徽地区;樱桃番茄;早春;大棚
-
番茄雄性不育研究现状与展望
作者：李翔;李涛;宫超;黎振兴;孙光闻
关键词：番茄;雄性不育;基因工程;分子标记;功能验证;杂种优势
-
豌豆蚜防控的关键RNAi靶标基因筛选与分析
作者：宗诗轩;李涛;黄清;程保平;赵弘巍
关键词：豌豆蚜;RNA干扰;精氨酸激酶;超氧化物歧化酶;几丁质合成酶;dsRNA;柑橘
