文献类型： 中文期刊
作者： 苏慧慧 1 ; 李涛 2 ; 黎振兴 2 ; 李植良 2 ; 王永飞 1 ;
作者机构： 1.暨南大学生命科学技术学院
2.广东省农业科学院蔬菜研究所
关键词： 番茄;GRX基因家族;生物信息学;表达分析
期刊名称： 核农学报
ISSN： 1000-8551
年卷期： 2015 年 29 卷 04 期
页码： 663-673
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： GRX基因家族是从原核生物到真核生物中普遍存在的一类巯基-二硫键氧化还原酶,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中均发挥重要作用。本研究在番茄基因组范围内,利用生物信息学方法对番茄的GRX基因组家族的成员、分布及结构和功能等进行分析。预测结果显示,番茄GRX家族包含55个蛋白质,分为4个亚族,其中植物特有的CC亚族成员最多,有35个,其他GRX基因成员与拟南芥GRX家族具有相似分类。在番茄GRX结构域中包含12个重要的基序,主要分布在序列的N端,相同亚族中的GRX成员蛋白序列的氨基酸保守域构成基本一致,且各亚族成员的氨基酸保守域组成特异,表明这些基序的存在对GRX蛋白功能的执行是必需的。利用实时荧光定量PCR对番茄GRX基因的组织表达和胁迫响应分析,结果表明,GRX基因具有组织特异性表达差异,CC型在根和花中表达较高,在果实中表达较低;在盐、SA、ABA、高温和低温胁迫条件下,22个番茄GRX基因的表达模式被阐明;其中部分基因的表达水平被显著地诱导增加或者降低,很可能参与了调控番茄逆境胁迫条件下的防御应答反应。本研究结果将为番茄GRX家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析GRX基因功能奠定基础。
- 相关文献
[1]花生赤霉素3-β-双加氧酶(AhGA3ox)基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 李海芬,鲁清,刘浩,温世杰,王润风,黄璐,陈小平,洪彦彬,梁炫强. 2024
[2]荔枝VQ基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应. 凡超,杨杰,陈蓉,刘伟,向旭. 2024
[3]中国辣椒AAT基因家族的鉴定及表达分析. 衡周,叶楚,方健敏,杨静,徐小万,徐晓美,李涛,王恒明. 2023
[4]白木香AsOMT1基因的克隆与表达分析. 杨艳,朱家红,曾军,梅文莉,戴好富,彭世清. 2023
[5]海南龙血树金属硫蛋白基因DcMT2的克隆和表达分析. 丁旭坡,吴春来,彭世清,梅文莉,戴好富. 2018
[6]荔枝HSP70家族鉴定及其响应非生物胁迫的表达分析. 凡超,杨杰,陈蓉,刘伟,向旭. 2024
[7]冬瓜WRKY基因家族鉴定及表达分析. 赵添悦,蔡金森,王敏,谢大森,杨松光,崔晓娟,高苏娟. 2024
[8]墨兰CsAP1-A基因克隆及表达分析. 周荣,刘嘉超,杨凤玺. 2023
[9]水稻磷脂酶D基因家族鉴定及表达分析. 曹华盛,李堂,熊亮,王福军,李曙光,顾海永,何高,梁世胡,罗文永. 2024
[10]冬瓜ARF4基因克隆及表达特性分析. 程晓欣,翟许玲,闫晋强,王宝琛,莫仁连,刘文睿,吴智明,江彪. 2024
[11]番茄组蛋白乙酰转移酶(HAT)的全基因组鉴定与分析. 史建磊,熊自立,李涛,张海利,宰文珊. 2020
[12]番茄AT-hook基因家族的鉴定及胁迫条件下的表达分析. 丁丽雪,李涛,李植良,徐小万,李颖,王恒明,王永飞,马三梅,黎振兴. 2016
[13]番茄HDACs家族基因在胁迫条件下的表达分析. 李涛,苏慧慧,李植良,徐小万,王恒明,李颖,黎振兴. 2015
[14]Ⅰ型鸭疫里默氏杆菌铁依赖抑制子RaDtxR基因的发现及生物信息学分析. 袁建丰,覃宗华,吕敏娜,吴彩艳,余劲术,孙铭飞,蔡建平. 2010
[15]马铃薯多酚氧化酶基因家族生物信息学及表达分析. 王丽,王万兴,索海翠,胡新喜,秦玉芝,李小波,熊兴耀. 2019
[16]‘航花2号’的Δ~(12)脂肪酸脱氢酶(FAD2)基因的生物信息学分析. 温世杰,李杏瑜,洪彦彬,李少雄,周桂元,陈小平,梁炫强. 2017
[17]‘航花2号’的Δ~(12)脂肪酸脱氢酶(FAD2)基因的生物信息学分析. 温世杰,李杏瑜,洪彦彬,李少雄,周桂元,陈小平,梁炫强. 2017
[18]转香蕉MaASR1基因的拟南芥株系在干旱胁迫条件下的表达谱分析. 张丽丽,徐碧玉,刘菊华,贾彩红,张建斌,金志强. 2017
[19]中泰南五味子转录组测序及生物信息学分析. 李静宇,徐友阳,蔡时可,王继华. 2022
[20]花生AT-hook家族基因的生物信息学分析. 胡冬秀,刘浩,梁炫强,吴自明,方加海. 2021
作者其他论文 更多>>
-
茄子新品种紫玉1号的选育
作者：李植良;孙保娟;李涛;黎振兴;游倩;衡周;宫超
关键词：茄子;紫玉1号;一代杂种
-
茄子种质资源表型遗传多样性分析及综合评价
作者：江姚兰;陈冠龙;李涛;孙保娟;李植良;游倩
关键词：茄子;种质资源;表型评价
-
不同砧木嫁接番茄对酶活和激素含量的影响
作者：梅文宇;黎振兴;陈兴平;宫超;孙保娟;徐伟杰;曾果;李涛
关键词：嫁接;番茄;砧木;氧化酶;植物激素;亲和性
-
青枯菌Ⅲ型效应蛋白调控植物免疫研究进展
作者：吴幕绵;陈舒婷;李涛;黎振兴;麦培婷;郝彦伟;宫超
关键词：青枯菌;青枯病;Ⅲ型分泌系统;效应蛋白;靶标蛋白;致病性;免疫反应
-
广东省冬种蔬菜产业发展现状及对策
作者：储霞玲;谢大森;李涛
关键词：广东省;冬种蔬菜;产业现状;问题;对策建议
-
人工气候室条件下番茄对弱光的形态学和生理学响应
作者：徐伟杰;胡英雪;宫超;孙保娟;衡周;李涛
关键词：番茄;弱光;叶绿素;活性氧;光合效率;转录调控
-
番茄叶色突变体研究进展
作者：胡英雪;徐伟杰;宫超;孙保娟;衡周;张余洋;李涛
关键词：番茄;叶色突变体;叶绿素;叶绿体;多组学分析;表观遗传学
