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基于转录组挖掘叶用莴苣中花青素生物合成代谢关键基因

文献类型： 中文期刊

作者： 姜永强 1 ; 王丽慧 2 ; 孙雪梅 2 ;

作者机构： 1.青海省农林科学院

2.青海大学农林科学院

关键词： 叶用莴苣;花青素;转录组;差异表达基因

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2025 年 41 卷 001 期

页码： 150-160

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究调控叶用莴苣叶片花青素合成的主效基因，本研究对叶用莴苣大速生（绿色）和紫霞（紫色）的转录组数据进行分析。结果表明，大速生和紫霞比较组中共检测到7 232个差异表达基因，其中相对表达量上升基因4 214个，相对表达量下降基因3 018个。KEGG数据库富集分析结果表明，富集到代谢过程中的差异表达基因最多，花青素生物合成和次生代谢产物-其他抗生素生物合成通路中差异表达基因富集程度较高。在大速生和紫霞比较组中共鉴定到55个转录因子家族，差异表达基因大多数属于MYB、bHLH、C2C2和AP2/ERF转录因子家族基因。从MYB转录因子基因中筛选出log2FC绝对值较大的LOC111917799,命名为LsMYB1基因。瞬时表达试验结果验证了LsMYB1基因可以调控花青素的生物合成。本研究结果为叶用莴苣叶色的分子遗传机理及进一步的基因功能研究奠定了基础。

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