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基于番红花转录组的碳氮代谢基因挖掘

文献类型： 中文期刊

作者： 周琳 1 ; 杨柳燕 1 ; 蔡友铭 1 ; 王桢 1 ; 张永春 1 ;

作者机构： 1.上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室

关键词： 番红花;转录组;碳氮代谢;生物信息学分析

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2020 年 02 期

页码： 265-274

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 番红花球茎是其开花和新球茎形成的基础,促进番红花种球中营养物质积累、提高番红花繁殖效率是解决国内番红花产量供不应求的有效途径,而番红花种球生长和繁殖与生长发育期间碳氮代谢途径密切相关,深入研究番红花生长发育机理,尤其是碳氮代谢途径是番红花栽培和繁育体系优化的前提。通过对番红花已有转录组数据进行从头组装,得到62 105条unigene序列。注释结果表明,仅有55.89%序列能够注释到公共数据库,注释到GO分类和KEGG注释的unigene分别为36 661和14 185条。通过生物信息学分析,挖掘番红花多个参与碳氮代谢的重要基因和转录因子,包含了蔗糖合成酶基因、蔗糖磷酸合成酶基因、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因、谷氨酸合成酶基因和碳酸酐酶基因等,以及转录因子GATA和DOF。研究结果可为番红花生长发育功能基因的发掘与利用研究提供参考。

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