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青贮玉米品质相关性状的全基因组关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘鹏飞 1 ; 王栋 2 ; 陈泽辉 1 ; 郭向阳 1 ; 吴迅 2 ; 王安贵 1 ; 涂亮 1 ; 祝云芳 1 ;

作者机构: 1.贵州省旱粮研究所

2.贵州省农业科学院旱粮研究所

关键词: 青贮玉米;品质性状;全基因组关联分析;单核苷酸多态性位点;优异等位变异;候选基因

期刊名称: 华中农业大学学报

ISSN: 1000-2421

年卷期: 2024 年 43 卷 005 期

页码: 65-74

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了初步揭示玉米粗蛋白含量、淀粉含量、中性洗涤纤维(neutral detergent fiber, NDF)含量、酸性洗涤纤维(acid detergent fiber,ADF)含量、可溶性糖含量和体外干物质消化率等性状的遗传规律,按照随机区组设计将183份自交系为材料种植于贵阳,测定玉米粗蛋白含量、淀粉含量、NDF含量、ADF含量、可溶性糖含量和体外干物质消化率,利用Maize SNP 50芯片对供试材料进行基因分型,采用混合线性模型进行全基因组关联分析,结果显示,分别鉴定出31、61、11、36、20和42个与粗蛋白、淀粉、NDF、ADF、可溶性糖及体外干物质消化率显著相关的单核苷酸多态性位点(SNP)(P<0.001),对表型变异的解释率分别为5.80%~11.40%、5.78%~11.38%、5.78%~7.85%、5.81%~10.37%、5.78%~7.35%和5.79%~11.33%。同时,发现SYN6712、PHM1190.3、SYN7541和PZE-104072386属于一因多效位点;其中,6号染色体上的SYN6712、PHM1190.3和SYN7541同时与淀粉、体外干物质消化率显著关联,4号染色体上的PZE-104072386同时与ADF、可溶性糖显著关联,经过等位变异鉴定发现T/T基因型是SYN6712和PHM1190.3的优异等位变异,并挖掘到了Zm00001d037272、Zm00001d037386、Zm00001d037532和Zm00001d051166等候选基因。

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