文献类型： 中文期刊

作者： 李泓 ¹ ; 田月瑶 ² ; 崔开明 ² ; 秦楠 ² ; 范道省 ² ; 田雪 ² ; 朱文锦 ¹ ;

作者机构： 1.河南省水产科学研究院

2.河南师范大学水产学院

关键词： 锦鲤;let-7家族;系统进化;let-7j;靶基因;体色

期刊名称： 河南农业科学

ISSN： 1004-3268

年卷期： 2025 年 54 卷 001 期

页码： 144-152

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对锦鲤let-7家族成员的前体序列进行比对和系统进化分析，检测锦鲤let-7家族成员表达量在体色形成过程中的变化，通过TargetScan和miRWalk对let-7j的靶基因进行预测，并对靶基因的本体特征和代谢通路进行富集分析，为了解let-7家族的进化历史及其在锦鲤及硬骨鱼类体色形成中的作用提供参考。结果表明，锦鲤let-7家族成员在鱼类中高度保守，且其前体序列的5'端保守性高于3'。锦鲤let-7家族成员表达量在体色形成的4个阶段均表现为逐步升高的趋势，在体色完全形成的孵化后47 d达到最高。利用TargetScan和miRWalk对let-7j的靶基因进行预测，其中571个靶基因在2个软件中均被预测到，这571个候选靶基因富集到了10个与体色形成相关的GO条目，包括色素沉积、发育过程的色素沉积、色素细胞分化、黑色素细胞分化、细胞色素沉积、黑色素小体转运、色素颗粒转运、色素代谢过程、黑色素小体定位的建立和黑色素小体定位；富集到与体色相关的KEGG调控通路主要有Wnt信号通路、ErbB信号通路和黑色素沉积通路。以上GO和KEGG通路中存在ltk、pmel、plin6、kitlga和pax7a等多个与色素细胞分化和迁移相关的基因。综上，let-7家族成员在鱼类进化过程中高度保守，可能靶向色素细胞分化相关的基因参与锦鲤红色体色的形成。