文献类型： 中文期刊
作者： 李崇奇 1 ; 沈文涛 2 ; 言普 2 ; 黎小瑛 2 ; 周鹏 1 ;
作者机构： 1.海南大学农学院
2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所
关键词： 巨桉;miRNA;EST;GSS
期刊名称： 热带作物学报
ISSN： 1000-2561
年卷期： 2014 年 35 卷 06 期
页码： 1108-1116
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 应用miRtour在线分析工具对巨桉的EST序列和GSS序列进行分析,预测巨桉的miRNA序列,应用psrobot预测miRNA的靶基因。结果发现205条miRNA前体序列和属于62个不同家族的170条成熟的miRNA序列,最大的miRNA家族为miR399家族,有17个成员;miRNA 5′段碱基存在明显的碱基偏倚,尿嘧啶出现频率高达40.6%;147个miRNA预测到了靶基因,共计预测到巨桉蛋白基因中有967个受到miRNA的调节,同时发现1个miRNA可以调控多个靶基因,同一蛋白质受多个miRNA调控的现象。
- 相关文献
[1]巨桉miRNA及其靶基因生物信息学预测. 李崇奇,沈文涛,言普,黎小瑛,周鹏. 2014
[2]5种桉属植物的miRNA生物信息学预测. 李崇奇,周鹏,蔡望伟. 2014
[3]基于EST和GSS序列的木豆miRNA生物信息学分析. 李崇奇,周鹏,蔡望伟. 2014
[4]巨桉EgrWRKY70基因克隆和初步表达分析. 姚海荣,曾炳山,范春节,裘珍飞,郭光生,覃伟权,阎伟. 2016
[5]不同接种和处理方式对巨桉幼苗青枯病发生的影响. 范春节,姚海荣,曾炳山,王胜坤,郭光生,覃伟权. 2016
[6]巴西橡胶树胶乳基因表达. K.H.Han,田郎. 2009
[7]香蕉EST-SSRs标记的开发与应用. 王静毅,陈业渊,刘伟良,武耀廷. 2008
[8]11种热带植物EST-SSR标记的开发和多样性分析. 黄启星,左娇,孔华,郭运玲,周霞,郭安平. 2012
[9]橡胶树EST-SSR标记的开发与应用. 安泽伟,赵彦宏,程汉,李维国,黄华孙. 2009
[10]油棕EST序列中SSR的分布特征分析. 吴春太,陈青,刘锐,李维国. 2012
[11]甘蔗EST-SSR标记的开发和多样性分析. 黄启星,张雨良,王俊刚,伍苏然,张树珍,郭安平. 2012
[12]牛大力块根cDNA文库的构建及EST分析. 徐立,郝宏刚,李志英. 2013
[13]橡胶树胶乳cDNA文库的构建及其EST序列的功能分析. 段翠芳,曾日中,聂智毅,黎瑜,魏小弟. 2007
[14]甘蔗抗逆与糖相关功能基因组学研究. 李娇. 2009
[15]通过胶乳转录组分析探析巴西橡胶树橡胶生物合成的研究. 田郎. 2009
[16]Construction of a cDNA library and preliminary analysis of expressed sequence tags in Piper hainanense. Fan, R.,Ling, P.,Hao, C. Y.,Li, F. P.,Huang, L. F.,Wu, B. D.,Wu, H. S.,Fan, R.,Huang, L. F.,Wu, H. S.,Hao, C. Y.,Li, F. P.,Wu, B. D.,Ling, P.. 2015
[17]Characterization of 31 EST-derived microsatellite markers for the pearl oyster Pinctada martensii (Dunker). Shi, Yaohua,Wang, Yan,Hou, Zhanhui,Wang, Aimin,Shi, Yaohua,Guo, Ximing,Shi, Yaohua,Hong, Kui.
[18]基于GSS序列的猴面花miRNA生物信息学研究. 李崇奇,周鹏,蔡望伟. 2014
[19]运用新方法鉴定木薯抗旱相关miRNA表达差异. 杨蕊菊,曾长英,陈新,宋顺,王斌,卢诚,彭明. 2012
[20]拟南芥中与植物生长和耐寒相关的miRNA表达载体的构建. 蔡杰,杨成龙,段瑞军,郭建春. 2010
作者其他论文 更多>>
-
番木瓜畸形花叶病毒HC-Pro蛋白的原核表达与纯化
作者：苏蝶;庹德财;周鹏;言普;黎小瑛;朱国鹏;沈文涛
关键词：番木瓜畸形花叶病毒;HC-Pro;原核表达;纯化
-
黄瓜花叶病毒香蕉分离物基因组全长克隆及侵染性克隆构建
作者：瞿青云;沈文涛;庹德财;言普;陈萍;周鹏
关键词：香蕉;黄瓜花叶病毒;进化树分析;侵染性克隆
-
三种复合侵染'心香'甘薯的病毒种类鉴定与分析
作者：王赫;沈文涛;庹德财;杨秀坤;言普;黎小瑛;朱国鹏;周鹏
关键词：甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.);病毒检测;Small RNA;RT-PCR;复合侵染
-
木薯普通花叶病毒侵染性克隆及GFP表达载体的构建与分析
作者：俞春烨;庹德财;沈文涛;言普;黎小瑛;周鹏;徐晶宇
关键词：木薯普通花叶病毒;侵染性克隆;植物病毒表达载体;绿色荧光蛋白;本生烟
-
三种复合侵染‘心香’甘薯的病毒种类鉴定与分析
作者：王赫;沈文涛;庹德财;杨秀坤;言普;黎小瑛;朱国鹏;周鹏
关键词：甘薯(Ipomoea batatas (L.) Lam.);病毒检测;Small RNA;RT-PCR;复合侵染
-
利用PLDMV/Twin-Strep侵染性克隆纯化HC-Pro病毒蛋白
作者：杨秀坤;沈文涛;庹德财;王赫;言普;黎小瑛;朱国鹏;周鹏
关键词：番木瓜畸形花叶病毒;HC-Pro;马铃薯Y病毒;蛋白纯化
-
海南槟榔苗期主要病虫害种类调查
作者：车海彦;曹学仁;沈文涛;黄丽云;罗大全
关键词：槟榔;种苗;病虫害;调查
