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家蚕中Brown候选基因的克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张静静 1 ; 牛宝龙 2 ; 孟智启 2 ;

作者机构: 1.浙江师范大学化学与生命科学学院

2.浙江省农业科学院蚕桑研究所

关键词: 家蚕;brown;生物信息学;RT-PCR

期刊名称: 浙江农业科学

ISSN: 0528-9017

年卷期: 2012 年 1 卷 02 期

页码: 240-244

摘要: Brown是一种色素运输载体基因(ABC transporters),与色素颗粒形成与转运相关,对昆虫的眼色形成有着重要影响。根据果蝇中Brown蛋白氨基酸序列,在家蚕数据库Silk DB中进行相似性搜索,并结合cDNA末端快速扩增技术(RACE)获得家蚕brown候选基因的cDNA序列,全长1 887 bp,开放阅读框(ORF)大小为1 797 bp,编码598个氨基酸残基,该基因组DNA含有外显子11个,且起始密码子在第1个外显子内。预测蛋白序列有典型的ABC_trans和ABC2_membrane结构域,同源性分析表明,编码的蛋白序列归类至ABC_trans家族中的Brown蛋白亚族。

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