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宗地花猪LOX基因CDS区克隆、真核表达载体构建及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王鑫 1 ; 徐龙鑫 1 ; 莫本田 1 ; 武俊达 1 ; 周文章 1 ; 张凯凯 1 ; 李干洲 1 ; 周迪 1 ; 杨蓉 1 ;

作者机构: 1.贵州省农业科学院畜牧兽医研究所;贵州省种畜禽种质测定中心

关键词: 宗地花猪;LOX基因;克隆;载体构建;生物信息学

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2023 年 59 卷 012 期

页码: 265-271

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究旨在对宗地花猪LOX(Lysyl Oxidase)基因编码区(Coding Sequence,CDS)区进行克隆和分析,构建其真核表达载体,并对该基因进行生物信息学分析.实验采用RT-PCR克隆方法,以GenBank中公布的猪LOX基因序列为模板,克隆宗地花猪背最长肌组织LOX基因CDS区序列,测序鉴定后进行生物信息学分析,同时构建该基因真核表达载体pEGFP-C1-LOX.结果表明:克隆得到LOX基因CDS区全长 1 260 bp,编码419 个氨基酸,编码蛋白的分子量为 47 009.34 Da,有 45 个磷酸化位点,为无跨膜区域的疏水性蛋白,其核苷酸序列与牛、鸡、黑猩猩、狗、驴、羊、马及人的相似性分别为 90.9%、74.6%、89.2%、91%、91.3%、90.8%、84.4%和44.5%,不同物种间相似性较高,进化过程中具有高度保守性,与牛、羊、驴、狗亲缘关系较近,LOX蛋白主要定位在细胞核.本研究首次克隆出宗地花猪LOX基因CDS区全长序列,并成功构建LOX基因真核表达载体pEGFP-C1-LOX,为进一步探索宗地花猪LOX基因功能及作用机制提供了理论基础.

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