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基于高密度遗传图谱的水稻萌发耐淹性QTL定位

文献类型： 中文期刊

作者： 孙志广 1 ; 卢百关 1 ; 刘金波 1 ; 刘艳 1 ; 李景芳 1 ; 迟铭 1 ; 陈庭木 1 ; 李健 1 ; 杨波 1 ; 刘晓敏 1 ; 王宝祥 1 ; 徐大勇 1 ;

作者机构： 1.连云港市农业科学院/江苏省现代作物生产协同创新中心

关键词： 杂草稻;萌发耐淹性;高密度遗传图谱;QTL

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN：

年卷期： 2024 年 001 期

页码： 21-29

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过对水稻萌发耐淹性进行QTL定位和稳定位点的聚合效应分析,可以为萌发耐淹性基因的精细定位及后续分子辅助育种奠定基础.本研究利用一个包含144份家系的强萌发耐淹性粳型杂草稻WR-4与籼稻品种广百香占的F2:3定位群体,基于1K m GPS SNP芯片构建了一个包含825个Bin标记的高密度遗传图谱,利用完备区间作图法共检测到10个萌发耐淹性QTL,分布于水稻第3、4、7、8、9和10染色体上,LOD值介于3.6~21.3之间,可解释3.0%~21.1%的表型变异.其中,具有较高LOD值和贡献率的2个主效QTL(q GS4-1和q GS7-1)能够被重复检测到,是后续基因克隆的候选位点.根据Bin标记分型结果将不同子代在两个稳定QTL区间内分为WR型和广百香占型,在F2:3群体中进行聚合效应分析,发现聚合增效等位基因数量越多的家系,其淹水条件下的胚芽鞘越长,这些携带多个耐性QTL的株系可为分子育种培育耐低氧萌发水稻新品种提供亲本资源.

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