文献类型： 中文期刊
作者： 王建伟 1 ; 贺晓岚 2 ; 李文旭 3 ; 秦绍钊 2 ; 汤宏 1 ; 余星 2 ;
作者机构： 1.凯里学院数学科学学院
2.凯里学院大健康学院
3.河南省农业科学院小麦研究中心
关键词： 油菜;Bn-HAM2基因;克隆;生物信息分析
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2022 年 20 卷 017 期
页码： 5588-5595
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： HAM2基因在植物生长、发育和应激反应中起重要的调控作用.本研究以油菜品种'美国油王88'和'南油868'为材料,通过PCR技术扩增HAM2完整编码区,利用生物信息软件进行序列分析,并通过PlantCARE对其启动子序列进行分析.结果表明,Bn-HAM2-MY88和Bn-HAM2-NY868的开放阅读框长度均为1 326 bp,编码441个氨基酸,分子量分别约为50.81 kD和50.86 kD,理论等电点分别为7.88和7.56;亚细胞定位预测分析发现该基因编码的蛋白主要分布于细胞核;功能结构域分析结果证实,Bn-HAM2-MY88和Bn-HAM2-NY868蛋白都包含有保守的MYST结构域,属于MYST亚家族成员;多序列比对及进化树分析结果表明,Bn-HAM2-MY88和Bn-HAM2-NY868与NCBI中公布的甘蓝型油菜组蛋白乙酰转移酶氨基酸序列(XP_013715766)相似性最高,分别为99.77%和100%,与拟南芥组蛋白乙酰转移酶序列(KAG7554717.1)相似性高达90%以上;启动子分析表明,除含有真核生物启动子TATA和CAAT固有元件外,还存在W-box、P-box、TGA-element、TC-richrepeats等多种响应逆境胁迫的顺式元件.本研究结果为进一步研究Bn-HAM2-MY88和Bn-HAM2-NY868的生物学功能提供了基础资料.
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