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脊尾白虾微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 贾舒雯 1 ; 刘萍 2 ; 韩智科 2 ; 李健 2 ; 潘鲁青 1 ;

作者机构： 1.中国海洋大学水产学院

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 脊尾白虾;富集文库;微卫星标记;遗传多样性

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2011 年 35 卷 12 期

页码： 1787-1794

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用人工合成的生物素标记(AG)15探针及磁珠富集法构建了脊尾白虾基因组微卫星富集文库。将脊尾白虾基因组DNA经HaeⅢ酶切后,收集400～1 200 bp片段,连接特定接头,与生物素标记(AG)15探针杂交并捕获含有微卫星的DNA片段,然后连接到pMD18-T载体中,构建脊尾白虾微卫星富集文库。随机挑取947个克隆,经菌落PCR检验,其中667个为阳性克隆。从阳性克隆中随机选取184个克隆进行测序,有150个克隆含有微卫星序列,共获得199个微卫星序列,其中完美型158个(79.4%),非完美型27个(13.6%),复合型14个(7.0%)。根据微卫星序列,设计了119对微卫星引物,64对扩增出稳定的具有特异性的条带,经30个脊尾白虾个体进行多样性评价后,有26个位点表现出多态性。26个微卫星位点获得的等位基因数从3～16个不等,平均每个位点扩增得到6.5个等位基因。观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及多态性信息含量值(PIC)的范围分别为0.111～0.929、0.246～0.932、0.231～0.909。本研究开发的微卫星位点将为脊尾白虾种群多样性研究、家系识别和种质鉴定提供有效的工具。

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