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海蜇(Rhopilema esculentum)磷脂酶A_2基因的cDNA、基因组克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨洪 1 ; 朱玲 2 ; 骆晓蕊 2 ; 周春娅 2 ; 庄志猛 2 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所;上海海洋大学水产与生命学院;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室

关键词： 海蜇;磷脂酶A2;cDNA;基因组;表达分析

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 2095-9869

年卷期： 2016 年 37 卷 06 期

页码： 123-130

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究利用RACE和RT-PCR技术克隆了海蜇(Rhopilema esculentum)磷脂酶A_2基因(Re-PLA_2-1)的cDNA及基因组序列,并分析了其m RNA在海蜇不同发育阶段的表达。Re-PLA_2-1基因的cDNA全长为824 bp,包括了48 bp的5?非编码区、504 bp的开放阅读框及272 bp的3'非翻译区。SMART分析显示,Re-PLA_2-1为分泌蛋白,包括了一个由19个氨基酸组成的信号肽和一个由118个氨基酸组成的磷脂酶A_2结构域。多序列比对和系统进化分析显示,Re-PLA_2-1基因与来自星状海葵(Nematostella vectensis)、僧袍芋螺(Conus magus)、长牡蛎(Crassostrea gigas)等磷脂酶A_2的相似性较高,共同聚类为pfam09056 GIX PLA_2分支,均包含pfam09056家族成员酶活性所必需的Ca~(2+)结合位点、活性催化位点和PLA_2结构域所必需形成二硫键的半胱氨酸。Re-PLA_2-1基因组全长为2671 bp,由4个外显子和3个内含子组成。RT-PCR结果显示,Re-PLA_2-1基因在海蜇4个发育阶段均有表达,其中,横裂体阶段的表达量最高,碟状体阶段最低。这些研究结果为进一步了解海蜇磷脂酶A_2毒素的生物功能奠定了基础。

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