文献类型： 中文期刊
作者： 蔡苗 1 ; 孙新颖 1 ; 刘庆慧 1 ; 万晓媛 1 ; 黄倢 1 ;
作者机构： 1.青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室农业部海水养殖病害防治重点实验室青岛市海水养殖流行病学与生物安保重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所;水产科学国家级实验教学示范中心上海海洋大学;济南大学前沿交叉科学研究院
关键词： 白斑综合征病毒;变异;缺失;单核苷酸多态性
期刊名称： 海洋渔业
ISSN： 1004-2490
年卷期： 2018 年 04 期
页码： 454-464
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为探究中国白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)的分子流行病学变异情况,选取2016年1-7月从我国3省9市采集到的47份WSSV阳性样本,提取WSSV核酸后,使用特定引物对目的片段进行扩增,继而进行测序并分析比较不同地区样本的ORF14/15和ORF23/24序列缺失情况,ORF75、ORF94和ORF125的VNTR及SNPs变化情况。结果显示,在ORF14/15的扩增中,有4种缺失片段,分别是6 540 bp、6 530 bp、5 950 bp和5 140 bp,而在ORF23/24扩增中则有3种大片段缺失,分别是12 073 bp、12 070bp和11 945 bp,在所有样本中ORF75的RUs数目分别为11、8、10、3,ORF94的RUs数目分别为5、7、8、11、14,ORF125的RUs数目为4、5、6。SNPs分析结果表明,ORF94片段中含有5个和8个RUs的在48位的碱基均为T,含有7个RUs的在48位的碱基为T、G、G、G、G、T、T,含有11个RUs的在48位的碱基为T、T、T、T、T、T、G、T、G、T、T,含有14个RUs的在48位的碱基为T、T、T、T、G、G、T、G、G、T、T、T、T、T,含有所有RUs数目的ORF125片段在8、18、25、66和69位置的碱基均为G、G、G、G和A,,而在9、50、53、61和63位的碱基则出现了4种变异。研究结果表明,2016年的样本中,WSSV毒株存在一定程度的变异情况。主要表现在ORF14/15和ORF23/24均出现了新的缺失片段,ORF75、ORF94和ORF125的VNTR以及SNPs变异情况也存在明显差异。
- 相关文献
[1]中国部分地区对虾白斑综合征病毒胶原蛋白基因缺失变异分析. 秦梦雪,刘庆慧,万晓媛,黄捷. 2017
[2]2013年中国典型对虾养殖区白斑综合征病毒流行株高变异区序列的分析比较. 孙新颖,万晓媛,刘庆慧,黄倢. 2016
[3]2015年中国典型对虾养殖区WSSV流行株高变异区序列的分析比较. 秦梦雪,孙新颖,万晓媛,刘庆慧,黄倢. 2018
[4]中国对虾不同凝集素基因应答WSSV侵染的表达差异. 高焕,赖晓芳,王伟继,孟宪红,孔杰. 2012
[5]热灭活WSSV诱导的中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)在不同温度下的免疫致敏反应. 曹家旺,孔杰,罗坤,栾生,曹宝祥,史晓丽,卢霞,冯亚萍,王军,王明珠,孟宪红. 2017
[6]2017年中国部分地区白斑综合征病毒3个基因的 变异分析. 刘晓娉,蔡苗,刘庆慧,万晓媛,黄倢. 2020
[7]3种来源的野生斑节对虾携带病毒情况调查. 杨丽诗,黄建华,孙苗苗,周发林,杨其彬,温为庚. 2011
[8]两种围栏养殖模式防白斑综合征病毒(WSSV)效果的比较. 闫冬春,董双林,黄倢,冯敏毅,余晓明. 2008
[9]蚯蚓与蝇蛆对中国对虾生长及抗白斑综合征病毒感染的研究. 张洪玉,张天时,孔杰,罗坤,常亚青. 2009
[10]人工感染白斑综合征病毒的克氏原螯虾的病理学试验. 雷质文,黄倢,莫照兰. 2002
[11]中国对虾几个产卵场群体携带白斑综合征病毒状况调查. 邓灯,张庆文,王伟继,刘萍,孟宪红,孔杰,孔晓瑜. 2005
[12]低剂量对虾白斑综合征病毒粗提液对斑节对虾体内潜伏期病毒及血细胞的影响. 张涛,郭志勋,黄建华,杨丽诗,温为庚,杨其彬,江世贵. 2012
[13]应用原位杂交技术检测感染中国对虾和克氏原鳌虾体内的白斑综合征病毒. 雷质文,黄倢,杨冰,史成银,俞开康. 2002
[14]PCR-核酸探针斑点杂交法检测痕量白斑综合征病毒(WSSV). 闫冬春,董双林,黄倢,杨冰. 2004
[15]WSSV~+斑节对虾的血清免疫相关酶对人工感染WSSV粗提液的反应. 张涛,黄建华,温为庚,杨其彬,郭志勋. 2013
[16]壳聚糖硫酸酯提高凡纳滨对虾抗白斑综合征病毒感染力的研究. 胡琳琳,房文红,高露姣,刘向阳,吴国忠. 2008
[17]苏北部分地区南美白对虾养殖场白斑综合征病毒流行病学调查. 陈一兵,万夕和,周俊芳,高崧. 2011
[18]中国对虾杂交优势对自然感染白斑综合征病毒的抗病力分析. 李素红,张天时,孟宪红,孔杰. 2007
[19]湖北地区克氏原螯虾白斑综合征病毒变异区ORF14/15、ORF23/24基因序列比较分析. 杨星,刘文枝,马杰,周勇,范玉顶,曾令兵. 2017
[20]中国对虾对白斑综合征病毒的类免疫反应与验证. 李战军,孟宪红,孔杰,单从文,罗坤,栾生,常亚青. 2012
作者其他论文 更多>>
-
罗氏沼虾神经细胞的原代培养及其在病毒研究中的应用
作者：黄笑;王国浩;董宣;唐琼英;段虎;杨国梁;黄倢
关键词：罗氏沼虾;神经细胞;原代培养;传染性早熟病毒
-
2021-2022年我国沿海养殖虾类中虾肝肠胞虫(EHP)流行病学调查
作者：余星潼;万晓媛;贾田畅;夏继涛;徐婷婷;姚亮;赵文秀;张庆利
关键词：虾肝肠胞虫(EHP);流行病学调查;TaqMan实时荧光定量PCR(TaqMan qPCR);组织病理
-
2021-2022年虾类偷死野田村病毒(CMNV)流行情况调查
作者：赵文秀;万晓媛;夏继涛;姚亮;徐瑞东;王伟;余星潼;张庆利
关键词：对虾病毒性偷死病(VCMD);偷死野田村病毒(CMNV);Taq Man探针实时荧光定量;流行病学
-
opaR基因缺失对AHPND致病菌生物学特性及毒力质粒接合转移的影响
作者：王利莹;董宣;王国浩;王德浩;谢景媚;罗婧斐;王显伟;黄倢
关键词：副溶血弧菌;opaR基因;生物学特性;Ⅳ型分泌系统;水平转移
-
噬菌体防治副溶血弧菌感染研究进展
作者：李文馨;许华;黎睿君;董宣;黄倢
关键词：噬菌体;副溶血弧菌;抗生素替代品
-
虾肝肠胞虫(EHP)现场快速高灵敏度检测试剂盒的性能评价研究
作者：李英瑕;徐婷婷;刘爽;万晓媛;张庆利
关键词：虾肝肠胞虫;环介导等温扩增;试剂盒;现场快速检测;性能参数评价
-
口服特异性卵黄抗体对凡纳滨对虾抗WSSV感染的免疫保护效果
作者：王仁宝;王一婷;张惠芬;宋晓玲;万晓媛;谢国驷;史成银
关键词：卵黄抗体;凡纳滨对虾;白斑综合征病毒;免疫酶活力;免疫基因表达;抗病力
