您好,欢迎访问上海市农业科学院 机构知识库!

基于转录组测序的枇杷腋芽成花相关基因的筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 章加应 1 ; 肖海涛 1 ; 张学英 1 ; 安海山 1 ; 徐芳杰 1 ; 周博强 1 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院林木果树研究所

关键词: 枇杷;腋芽成花;转录组分析

期刊名称: 上海农业学报

ISSN: 1000-3924

年卷期: 2022 年 38 卷 006 期

页码: 47-57

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以枇杷品系春花(具有腋芽成花特性)和品种'火炬'(不具有腋芽成花特性)为试验材料,利用RNA-seq技术对枇杷腋芽进行转录组测序,以期筛选出调控枇杷腋芽成花的关键基因.结果表明:共鉴定到66 197条差异表达基因,其中上调表达基因主要集中在2月27日-4月8日;维恩图分析显示,不同取样点共同上调表达的基因有160个,共同下调表达的基因有198个.差异表达基因GO功能注释到3个大类(生物过程、细胞组分和分子功能)的48个功能组,KEGG通路显著性富集分析表明,差异基因主要被注释到20个途径上,富集于植物激素信号传导、淀粉和糖代谢、苯基丙烷代谢、植物-病原体互作反应和谷胱甘肽代谢等途径.经功能注释后,最终从腋芽转录组筛选到32个成花基因、1个ABA受体基因PYLA、1个ABA脱氢酶基因ABH4和大量功能未知的新基因,这些基因可能在枇杷腋芽成花途径中起重要作用.本研究有助于更好地了解枇杷腋芽成花过程中的基因转录水平,也可为进一步解析枇杷腋芽成花的分子遗传机制奠定基础.

  • 相关文献

[1]利用转录组分析茉莉酸甲酯对金针菇原基生长的影响. 李玉,朱秋瑾,李巧珍,陆欢,王瑞娟,杨慧,尚晓冬,刘建雨. 2022

[2]茄子耐低温性差异材料的筛选及其转录组分析. 朱宗文,吴雪霞,张爱冬,查丁石. 2021

[3]基于转录组挖掘香菇木质纤维素降解相关基因. 刘慧杰,游潇轩,戈永杰,尚晓冬,谭琦. 2024

[4]低温胁迫影响大麦小孢子全能性机制解析. 李文瑞,李颖波,郭桂梅,宗营杰,周龙华,徐红卫,刘成洪. 2024

[5]番茄含糖量不同的两个材料果实转录组初步分析. 张文昊,张辉,刘雨婷,王艳,张迎迎,王馨曼,王全华,朱为民,杨学东. 2024

[6]应用枇杷二代测序数据进行染色体步移研究. 蒋爽,安海山,徐芳杰,张学英. 2020

[7]氟节胺抑制枇杷嫁接成苗砧木萌蘖相关机理初探. 徐芳杰,徐志宏. 2020

[8]枇杷果实坐果前后差异基因筛选. 任燕,张学英,安海山,徐芳杰,蒋爽. 2020

[9]上海枇杷温室栽培研究. 张学英,骆军,杜纪红,叶正文,夏琼. 2010

[10]枇杷新品种‘火炬’的选育. 张学英,骆军,叶正文,徐芳杰,施春晖,王晓庆,杜纪红. 2017

[11]枇杷贮藏保鲜技术研究与展望. 乔勇进,王海宏,方强,徐琴,张绍铃. 2006

[12]上海枇杷设施栽培研究进展. 张学英,骆军,杜纪红,叶正文,夏琼. 2009

[13]2004~2005年冬季低温对枇杷开花结果的影响. 张学英,邵文慧,吴利荣,叶正文. 2005

[14]上海地区白沙枇杷栽培关键技术. 张学英. 2007

[15]枇杷新品种'火炬'的选育. 张学英,骆军,叶正文,徐芳杰,施春晖,王晓庆. 2017

作者其他论文 更多>>