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中华鳖GHSR基因SNPs的筛选及生长性状的关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李纯 1 ; 陈辰 1 ; 赵建 1 ; 洪孝友 1 ; 李伟 1 ; 朱新平 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院

关键词: 中华鳖;GHSR;SNP;生长相关

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2019 年 01 期

页码: 14-18

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探究GHSR基因多态性对中华鳖(Pelodiscus sinensis)生长相关性状的影响,采用直接测序法在GHSR基因5'侧翼和3'侧翼上筛选SNPs位点,共检测到5个单核苷酸多态性位点:A335T、G397T、A527G、A13482C和T13526A。随机选取同批繁殖的1冬龄200只中华鳖用直接测序法进行SNPs位点的分型,并分析与生长性状的相关性。检测结果显示,所有SNP位点均符合Hardy-Weinberg平衡状态(p>0.05)。方差分析显示,A336T位点的AT、TT基因型的体重、背甲长、背甲宽和裙边宽4项生长数据均显著高于AA基因型。A13482C位点的AC基因型的体重、背甲长、背甲宽和裙边宽4项数据均显著高于AA基因型(p<0.05)。研究表明,本实验在GHSR基因上获得的这些SNP位点可能影响着中华鳖的生长性状或与之紧密连锁,可为中华鳖分子辅助育种提供助力与参考。

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