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玉米大斑病菌钙/钙调素依赖性蛋白激酶(CaMK)基因家族的鉴定与表达模式分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吴迪 1 ; 赵梓彤 2 ; 李志勇 3 ; 杨峥 1 ; 檀迎会 1 ;

作者机构: 1.河北农业大学真菌毒素与分子植物病理学实验室

2.河北农业大学生命科学学院

3.湛江中心人民医院

关键词: 玉米大斑病菌;钙/钙调素依赖性蛋白激酶基因(Ca MKs);基因鉴定

期刊名称: 农业生物技术学报

ISSN: 1674-7968

年卷期: 2015 年 23 卷 08 期

页码: 1020-1030

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 钙/钙调素依赖性蛋白激酶(calcium/calmodulin-dependent protein kinases,Ca MKs)是真核生物钙信号途径中钙调素下游的一类重要靶蛋白,能够引起众多代谢的关键酶或转录因子磷酸化,从而完成对细胞代谢活动或某些基因表达的调节。本研究利用简并引物从玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)中克隆到4个Ca MKs基因片段,分别命名为CAK1、CAK2、CAK3和CAK4,通过3'RACE和5'RACE得到全长c DNA,CAK1、CAK2和CAK3序列提交Gen Bank,登录号分别为EU605885、EU605886和EU605887。CAK1基因开放阅读框(open reading frame,ORF)1 218 bp,3'非翻译区(untranslated regions,UTR)317 bp,5'UTR 500 bp,编码405个氨基酸;CAK2基因ORF 1 194 bp,3'UTR 400 bp,5'UTR 563 bp,编码397个氨基酸;CAK3基因ORF 2 304 bp,3'UTR 405 bp,5'UTR 207 bp,编码767个氨基酸。生物信息学分析表明,CAK1、CAK2、CAK3和CAK4属多功能Ca MKs,均含有12个激酶保守基序;4个Ca MKs的激酶保守结构域分属不同类型,其中CAK1和CAK2含有典型的Ca MK类丝/苏氨酸蛋白激酶催化结构域,CAK3含有LKB1/Ca MKK类丝/苏氨酸蛋白激酶催化结构域,而CAK4含有RCK1样丝/苏氨酸蛋白激酶催化结构域,并分别与真菌的Ca MK、Ca MKK和MAPKAPK有较近的亲缘关系。实时定量PCR(Real-time quantitative PCR,q RT-PCR)分析表明,在诱导分生孢子萌发并形成附着胞的过程中,CAK2和CAK3表达较活跃,各时期表达水平均接近或高于对照,诱导6和24 h时,表达显著上调(P<0.05);CAK1和CAK4则在各时期表达水平均显著低于对照(P<0.05)。本研究获得了玉米大斑病菌中4个Ca MKs基因,并初步明确了其在病菌侵染结构发育过程中的表达模式,为深入研究该病菌Ca2+途径的作用机制提供了基础资料。

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